2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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. A) R& \6 q& E. F+ \3 n 消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。
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2 I# Q H. V, V5 f, b 对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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1 I5 x% z! B9 m 根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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5 w# k1 V: y! ~$ l" |" J% o 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。
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; w$ b2 B1 W* A 英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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NPI依据的18本期刊如下：
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Nature9 G% W6 a3 L9 }# n" l8 i: N6 _
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Nature Biotechnology
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2 m" X% p$ G' U2 N5 h4 h. h Nature Cell Biology9 U: O( W! o& e6 O m( F9 G) i
& I) }6 x' {0 v5 p Nature Chemistry
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Nature Climate Change
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Nature Genetics$ E9 e1 }8 w0 W" p1 D- i4 e$ J8 X* G
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) a" A5 ]5 E5 [. b0 G Nature Immunology' x8 ` V* {2 V4 b% d% `7 I
) Q- R5 y: R$ e6 B* g0 h Nature Medicine
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9 t& h0 E. g- [% E+ ~6 A$ F+ e8 X' O Nature Materials
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Nature Methods! A0 x' T \. j) `$ ^" M
$ l) l4 A( z2 }% }' K Nature Neuroscience. B6 {) G1 |* o8 z
' ~5 ~2 j3 f; g9 n- i
Nature Nanotechnology
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1 g+ Y# T$ y: O3 g Nature Photonics: a3 M. r% c) U& H0 H% ~
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Nature Physics
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Nature Structural & Molecular Biology0 u: V3 a3 _6 J
1 G- W. Z/ @! E- W 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
1 z* J- ?) e: Z* ], R4 L
( x, g5 F" ?% I' _/ O l* O" f NI依据的68本期刊如下：
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Advanced Materials) m; h8 V! d8 z( K1 S4 D, R1 o
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American Journal of Human Genetics
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Analytical Chemistry
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Angewandte Chemie International Edition/ g- B( n# H9 O8 C! `* Y
) S, L. y/ q8 Q8 r, C Applied Physics Letters
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Cancer Cell
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Cell（《细胞》）
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Cell Host & Microbe8 y; {2 b) V& M7 Q- e6 k7 e# v
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Cell Metabolism
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Cell Stem Cell
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Current Biology: K" k Y! J5 o Y/ B6 }. b
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Ecology Letters
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Genome Research
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Inorganic Chemistry: l. u2 C" ~$ p$ n, F
5 o9 d8 ~1 k6 S" d Journal of Biological Chemistry
- a( b- b4 c( z5 c# X8 _3 B u" H$ E
Journal of Cell Biology. m/ G9 @9 O% M( V9 d( E8 g0 G* O
- H, h7 W% R# W* x Journal of Clinical Investigation5 z8 q4 W; b! Z: d$ p; p8 i
) _. q. ], u* B% v8 z( v
Journal of Geophysical Research: Atmospheres; S! z; _2 Z) z# b* }
; F: ~( W, |) M% Q- i Journal of Geophysical Research: Oceans
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9 k6 K( o: \9 D# y Journal of Geophysical Research: Solid Earth
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5 c% N. o& I0 L Journal of the American Chemical Society2 k! U. U& d1 \% l7 N
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Monthly Notices of the Royal Astronomical Society
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Nano Letters
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Nature （《自然》）( Y9 C* E- D+ G7 y
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Nature Biotechnology
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" p6 G6 R0 r2 Q5 K. I$ r* Z4 E Nature Chemical Biology
4 k8 Z+ [5 a- |8 O- k+ F, E( n M7 w1 d1 T5 l) b" Q
Nature Chemistry
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, I& t4 z3 c+ d f& E6 v+ e5 M Nature Communications
9 B9 s% N. b' m$ W$ u3 ~, [5 Y1 N+ V" A
Nature Genetics
0 k" f% s* J S4 m3 p [& `2 S8 D( o* @4 x( W) E- s
Nature Geoscience! m+ ~ A6 ?) ^0 L
4 q( j! d! y! I7 z$ z. n* R2 l Nature Immunology
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h2 O$ B2 n/ R& G Nature Materials
( F. d U- B; \7 J( [7 e
( [3 u( `2 P, ]- X4 a& F Nature Medicine
7 ]2 j3 o, g. X9 g# o' |, \7 t) U/ w7 r6 t
Nature Methods* g7 t2 d) O/ H8 p
, h8 Y$ ^, C4 v Nature Nanotechnology
+ g l: Y% }# [# F, h m! p7 H% i# i0 c9 A3 s5 M- M& v
Nature Neuroscience8 n5 o, d W6 L5 t, n# v1 Q2 C
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8 `4 Q( m" R# k& G0 v Nature Physics/ }& r! T, g2 W1 S
* a/ F- r5 a& e. D5 |6 B3 V Nature Structural & Molecular Biology+ h: E& @1 X1 f; s, [
) A O& G) \8 [ V& [ Neuron# R# [) q2 a% k" L
: P6 D/ Q. @$ r9 Z
Organic Letters5 U7 m) P9 C: p7 G# Q0 D
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Physical Review A* d, W0 k1 I1 I& L9 z. [' V s
) h" L( g4 e; R4 M8 v/ j6 g' T
Physical Review B, {+ O* ~" k/ ^/ w8 @5 q w" h& s
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Physical Review D
; M0 _2 S% q B/ A* F
' K1 i" S) k/ M Physical Review Letters" A; s( c; M' ?5 ?6 A, j5 B6 ]4 H
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Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
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Proceedings of the Royal Society B
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: d* z8 q: r9 |' Y9 E5 d
! r" c5 N% E9 O' }6 V- M. K The Astrophysical Journal Letters
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$ u6 j, G6 ~2 T9 ~! a The Astrophysical Journal Supplement. t1 @8 s$ m8 j G
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The EMBO Journal+ W1 I% N: h/ _4 y3 B: r4 _/ D
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The Journal of Physical Chemistry Letters
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