2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。: N6 J. ~6 W$ L3 \
0 {0 D7 N1 A& M; D% e' }
对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。- _7 I$ r, O$ I) z, q
5 E* y. x# P6 d: ]" C0 a" S( D
( u$ ^0 W/ Z9 t: o# g' N
/ P4 k, j& j+ x/ u k- a1 c
* M+ {' I4 F" G: |. s- P4 \4 Y 由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。7 g% H. e" E% B7 C& b7 R
5 P9 }& V" F2 [; [
根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。5 s- K1 n# e# f$ c
+ Q: c( T! i; Y- R, @* a1 i. t8 i9 H 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。, N% d6 r5 I; R. s! `# ?
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NPI依据的18本期刊如下：( E4 w/ |& J8 b7 `' s3 F: x5 q
$ P N& N# S# g) `: x+ } w/ s
Nature
# h& M6 C9 D6 _9 A
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% U l2 Q1 D7 C/ t! s8 O. s7 a) D' ~9 D. Q/ b/ w- H; r
Nature Cell Biology
@+ g9 j% y; J& F7 w I% G3 d8 v: C
Nature Chemistry
8 y0 g) {; l9 V3 [1 ?4 N1 f# J1 }
1 O# a( W' s1 o Nature Chemical Biology
8 B& X& R$ d5 ~: p" c3 Z9 Z( A1 E) L
Nature Climate Change s7 H1 p+ H) [5 }1 B# C' ~$ T
D3 R7 m/ f+ n# K8 S
Nature Communications
3 l1 n$ `9 P8 _5 Z* y$ g
+ _9 T% N- J( l. \% N& N% G+ q$ Z Nature Genetics. f+ X6 J* a2 F8 ^( L
* Z, V- A# R, a9 c5 A Nature Geoscience3 u8 B7 t! W( O) u" g7 V, k: A
5 U, |( s- c6 {$ V. ^2 L* X. a! J# o Nature Immunology
. E- P! S+ N8 b, i9 t& b8 m; ]$ I9 G+ d0 `- c6 g ~* H
Nature Medicine! k: G# n3 X1 |# T- e4 \! D
: _: m1 P1 C, m3 w& K
Nature Materials
9 _" f1 j6 P4 T$ q' k; q- N4 G4 y9 u9 Q$ ~; l6 Z2 r
Nature Methods
' S8 u5 t7 G y# X! R; ^
+ f# q$ Q [# D7 \% Z& @ Nature Neuroscience
+ T& b+ O. Z/ d2 l1 ^+ s
" B8 q& F) w' A0 p Nature Nanotechnology2 j" v7 W/ @( c D
* S( O5 j0 Z& B+ f* g- U
Nature Photonics
; e( g) f1 H; ~1 p9 Q! v. v
6 @9 M! R3 @8 \) j8 r. K7 T( s Nature Physics3 V5 r" C z, {/ Q- i7 q( e2 j
4 Q# H# [. F( u1 t. t
Nature Structural & Molecular Biology
]) r. x5 E8 _) i& Y
! J: E, E' a+ y& q+ k' q* i 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
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7 {$ ]0 l1 e0 {2 J NI依据的68本期刊如下：
* y, e/ J, _5 ~. O% \; ^& f+ O& y1 v( A$ C6 n
Advanced Materials
$ {6 Z' k1 \, U3 _
# f: V( L* t7 r American Journal of Human Genetics
. {: Q: v4 q; r+ i% O& W7 ^4 [5 \ z/ B* K, A1 x" R
Analytical Chemistry3 [2 F# s, k! H5 |
* f- t2 o$ F# A$ p- {" o0 g- ?
Angewandte Chemie International Edition
( C, @3 q4 M7 P1 `1 \5 T+ Z' M. E' I/ L
Applied Physics Letters' L5 Q0 W! B* S
8 b- A; ^! d2 w# {" Y0 Y Astronomy & Astrophysics$ c4 u' x% x3 ~, C% n$ I
. i; B* m6 r; u2 y/ X
Cancer Cell
) y. c) E* A7 b; C2 M. a1 ?9 ~! T: K3 J5 d1 B {; y' z3 J
Cell（《细胞》）
% u3 T. e j) Q2 {
5 h) O" \/ V, b7 s* ~ Cell Host & Microbe0 C; s7 A3 q) Z+ f" S% ^, t
3 l; H( v7 U+ r1 K
Cell Metabolism
+ x; d- J1 I! q0 Y+ p7 M! m; s; j# F% w* c9 W
Cell Stem Cell
* P' A5 X! y! G/ Q' z5 A2 O. m
9 R+ e+ N, w" [% m" D' @( m Chemical Communications1 \* U* e/ p7 p+ d
- z) v% Z \7 h8 |0 w, @; g2 ~
Chemical Science
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7 V6 @8 C5 i$ W Current Biology8 G, ]. q+ B' l- T5 L3 |
# c0 `2 K! m9 i* V Q. L Developmental Cell' U3 h* k; Z. p4 ~
0 [0 u$ X( `$ j! a6 l1 b8 Y Earth and Planetary Science Letters
3 u: `) ^# `8 B; H6 ?: n5 e; z# V2 l. E( W% J
Ecology
* C& q4 K6 Q8 t; j. j
$ |# j$ k9 P* T/ P* Y3 j Ecology Letters- i ~4 c3 j& F b7 z+ n
! A: B1 d: h0 g: e European Physical Journal C
: s& W; `/ G# N7 U' i( ]; E
9 p, j- \4 \6 u, |1 f Genes & Development
- N9 ~8 C' a/ L2 I$ E* z. E
# F& }4 f; ]9 r- w Genome Research$ e4 o7 q! I% z2 L/ S5 i
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& j; P; G* Z: D# o
Immunity2 L3 b! _2 E' k4 W# V/ x/ h$ t4 `
# D) [: D) i7 S# _4 O# D5 g Inorganic Chemistry3 T, a+ Z" v0 W: S8 b
8 ^6 B' ^4 h! W8 V
Journal of Biological Chemistry
: W ?* ?' A" z: }6 F/ I& g& v
* G& m; ~3 y) l% ~- }4 q- H Journal of Cell Biology
6 L+ Q; _- |" ~# K5 X6 n8 A4 T0 @ D
Journal of Clinical Investigation4 D W2 V0 Z" E/ x0 R- C* h" o
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Journal of Geophysical Research: Atmospheres3 T2 V& r! A. ^
* J' Z8 p) x, b4 O: S
Journal of Geophysical Research: Oceans! a& `2 _/ v' y" N
3 E- b3 r" k0 Q$ c& `; r% `7 Y5 a: B
Journal of Geophysical Research: Solid Earth
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Journal of High Energy Physics/ U+ \- p% u/ V- S6 w4 \6 r$ Q7 N
9 o6 P9 p, _% f, f1 n. m
Journal of Neuroscience
1 L b2 R( |: |/ t, E0 [$ _ w% g9 t
k) t8 W' J7 V Journal of the American Chemical Society
1 ~1 |# L) p+ Z3 M6 n/ F, H3 m: T- d6 f+ ]8 d8 Z4 ^, W- n
Molecular Cell8 U& }- @; k; R. |6 X
3 }3 _# {6 A4 v9 J
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2 Z: l/ J5 o* s: b3 }4 x$ w
Nano Letters
& V6 e6 ?& ]" z, \
( e! M3 S: [& _ Nature （《自然》）
& D: W. e$ d+ F! P7 J3 {
" C/ S M5 e4 b! m% J Nature Biotechnology
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8 ]; F. v8 y9 m0 t1 ~7 b% R, A# \ Nature Cell Biology
3 R) w5 X4 E# j4 P# n* N7 _0 T2 g0 Z! y
Nature Chemical Biology
7 [8 P% X' {. m$ K a, y& P, R2 J& }1 _( E
Nature Chemistry
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Nature Communications
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Nature Genetics
6 E! Y% ], {1 v5 b. M+ Y( \& m
- s& z- l& E5 X! e Nature Geoscience0 o" b0 p; L& e* |
3 K% f) {% I' | W# s
Nature Immunology
6 l: M& }4 ~8 i5 n' a
8 S& ]5 _6 Y( D- H! P5 u Nature Materials
& g; E+ g3 m4 i7 r1 [8 }" h" w
' r/ F$ Y$ C; t- K0 |; R Nature Medicine
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Nature Methods
- [) p6 O, G, I0 T b
, M. I& T3 o) p+ J* a Nature Nanotechnology
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Nature Neuroscience
: H: Q- F/ A2 L% v6 [0 O7 L5 J6 G7 q! Y# f% x% N4 B
Nature Photonics
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& \' p1 g/ D% ]- v4 V Nature Physics
1 p* [6 Z1 A3 T0 C* B# Z' ~: V4 b
4 e9 [' @+ A9 |: q* |/ L: @ Nature Structural & Molecular Biology0 o2 @3 |# u& M" P, A( G
`' n! h6 B) K. E! i& f) ]( ~6 F- z2 ^
Neuron" n6 O. k! d- p' |9 V
_% t ?: g; r9 {* J5 h Organic Letters
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PLOS Biology: f. @% d$ T9 [
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Physical Review B+ I+ d# u8 s" Z0 n% P( y: }
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The Astrophysical Journal Supplement! H1 H( b% D3 Y+ M; z
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9 l* \; b/ N* X7 ^3 o- F3 o1 N The Journal of Physical Chemistry Letters% X6 y& O5 t. }6 Q: ?4 c1 B# i; S
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