2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。' F% d" B% K' i/ L/ C; F: b
( W- {& o' e x' T1 M8 Z( ~- B9 T 消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。
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, ^, }& {5 _+ B 对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。; R9 \; u, H& n' p9 w+ C9 ~: @
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根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。6 Q3 N: u3 Z; Q. X$ x# b
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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NPI依据的18本期刊如下：
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Nature
- F6 ~% J4 N8 ~" f' g. d% T, P
; L) O2 {/ U# N( x& U Nature Biotechnology1 J: Y. u; z: ]2 I9 D
9 P: z- ~+ K8 ^0 H2 S Nature Cell Biology
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Nature Chemistry
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Nature Chemical Biology/ _; N* J( K/ ^( z$ H6 l- ^
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Nature Climate Change
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Nature Communications
: i5 w0 x: N# o7 U5 K5 x, R
- O( m w% h$ G, A4 \8 K5 l8 y Nature Genetics
/ b4 {) o4 o& z/ i$ b8 s u9 q6 u( k# Y( o6 Q; C( ]( D, V, Q* E
Nature Geoscience
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# n$ w6 p* P4 S" M& R( ^; l Nature Immunology2 ~( _; t" A7 |& x0 a. t D
5 T6 E! H9 A2 w0 S9 y9 H Nature Medicine7 d3 K7 p1 Z6 c" ]
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Nature Materials$ F3 o B4 I7 J5 t; Z" |
5 E$ c' w) d9 a. X4 ^- [9 ^
Nature Methods
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Nature Neuroscience
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. b& r5 T$ R4 \$ _8 ] Nature Nanotechnology% I# X4 P' y/ A D3 u" |- j
! a6 Z6 U& l9 p; E- I# y `
Nature Photonics
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* \6 q/ @2 Z& R9 [8 Y Nature Physics
7 R# z# u5 B( P% [" q: K. l9 o5 M4 u% Z# M5 c
Nature Structural & Molecular Biology
4 X3 v9 N* k: P8 j: u
, _/ H* [; g9 O 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
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; h* D: `, P+ a NI依据的68本期刊如下：2 J$ u2 V6 r1 B3 s4 p W
! n# Z: S3 M* z! D3 J$ S$ s
Advanced Materials9 f4 W3 ?. U) c" m* b7 Q0 R! |
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Analytical Chemistry1 S6 p) s6 v" w. B( l$ A
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Applied Physics Letters; }4 }6 |- }) F+ Y# T1 M% k* I
8 ?; T3 k* g g6 q
Astronomy & Astrophysics
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Cancer Cell
6 i9 V& z3 F5 W7 m" {/ C$ W4 F) [- a! H2 @
Cell（《细胞》）
9 `% }2 C* C: w }4 u- ?! Y7 S* M( [& j# ^2 \
Cell Host & Microbe
7 R! h8 p& w& o/ c6 H' s* _& H8 |9 d# M. H8 p* b, }# H
Cell Metabolism
7 L! ]8 v0 F, J: P$ e; T3 {& E! p% G& Z" R1 i' u' f# B! Z8 {, D
Cell Stem Cell
8 z4 y. t% N8 g+ W3 K( T a/ _. @3 H
Chemical Communications
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Chemical Science- R/ w2 \6 ^0 b, Z- Z% Q) X; A3 B
8 g% t% Y& m- p3 b Current Biology" @5 N4 Y' |! Y' Q
, V& W3 @' _# R" J Developmental Cell" G7 t8 H2 d7 q7 Y! H
O) Y1 e0 k# M% `$ K* d/ a Earth and Planetary Science Letters
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v* P! F# t8 H" F( m) U6 ^( D' e Ecology
& L; L" V7 Y! _6 {* g5 u5 _
* M' P' Q" S: c# c+ o# p Ecology Letters
' I! w5 |8 C/ c- ]' j
' W i4 } [8 c* n' o9 U$ q European Physical Journal C
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3 d1 c6 v2 o |7 a1 Y Genes & Development4 k7 O% G8 U9 D" z4 P. `
2 B: ^% B0 p' ?, c# F# E0 ~ Genome Research1 z6 q, C' T5 u$ `- z5 l
3 E6 O5 X- D7 N) t" H Geology7 ?6 p' B# j3 @: o/ M& y' _
7 h4 I+ R8 y0 ^; o6 w/ M Immunity
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4 `+ d7 q7 e+ @ Inorganic Chemistry( H' h0 ~: D _9 f4 L9 u/ G3 q6 S
0 w( j* I+ k" h2 y7 {( f
Journal of Biological Chemistry e, k+ z# {& n3 J; i, d9 I# }
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, }' Y$ I7 p0 ~/ l Journal of Clinical Investigation
d9 H6 a) k! Z; Q3 h" y7 t. M6 I) N1 O+ R5 j* T% {
Journal of Geophysical Research: Atmospheres
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Journal of Geophysical Research: Oceans, h! R! y' y T7 b( b8 Y6 |
* E. D. @7 o- R" Q9 J Journal of Geophysical Research: Solid Earth
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Journal of High Energy Physics
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Molecular Cell
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Nature （《自然》）
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Nature Biotechnology9 L; L1 w! }( |
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Nature Chemical Biology
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Nature Chemistry
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Nature Communications
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Nature Genetics! N9 g: l0 s* x, Q
1 `- _* [. F0 b Nature Geoscience
3 w/ Z' j- n9 \& U8 f
0 o- Y7 Q1 `" G$ Q$ x+ b Nature Immunology
* q' Z0 _5 K1 X6 U- M: @/ f4 H4 m( C0 n3 j5 }$ s8 m$ E+ n
Nature Materials
* ^; S$ B+ f* j! `( |& m6 P- [8 i2 w6 Z" t% n" g1 \( e
Nature Medicine
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Nature Methods1 w: i% z; S8 h) b- i3 k
8 V9 C0 |4 }: c v: b Nature Nanotechnology& K/ s" d% H( B! F# h _: \* l% n
B) q+ z" a# Y Nature Neuroscience a+ G/ R8 j" l( H1 m( Q
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Nature Photonics
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Nature Physics8 K& g- t! z) Y1 O* f' f
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Nature Structural & Molecular Biology
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Physical Review A+ ?5 c' e4 w6 w& F! G
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Physical Review B9 [2 X! @/ w* C6 @, G6 k m
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Physical Review D4 ] U5 u1 w5 e3 u' B. f
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Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
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