2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。9 S0 l1 q5 [, Q9 y. b
/ v% ]/ }, @" k 消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。
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对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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% F* p& _' ^( T" k& e; }* u 2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。/ x- b5 f+ R' ?4 l* M& S! e! o
P! k3 S4 ^) e! F2 K 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。& O: e* q4 i9 o% I( ~
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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NPI依据的18本期刊如下：/ f# W) X& O2 I5 n; {3 a
3 |% V- {( ~! z8 H+ p Nature
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2 [1 E( @/ _& W C" U8 B6 Q0 T Nature Biotechnology& T o$ z0 N! d; X* P$ _
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Nature Chemistry
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Nature Climate Change
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8 l8 B" \ q- j3 M Nature Geoscience
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8 ?% t: \+ O; W) B Nature Immunology
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Nature Medicine
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0 |" T S1 u8 y3 ^ Nature Neuroscience& ]3 `& h6 x' B1 w3 a: @, u
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Nature Photonics. h, |/ I7 u! A( c3 k' L3 m# k
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而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
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NI依据的68本期刊如下：" { _2 N! k- u! H
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Advanced Materials( k [& e9 Z8 H# c
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American Journal of Human Genetics Q1 k9 R; W5 P- O- _ s8 @; L
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Angewandte Chemie International Edition2 K: |2 m* Y' j1 E9 M
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Applied Physics Letters) ?3 m# F( g& g
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Astronomy & Astrophysics) b. Q( @9 N9 O. i5 J& E
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Cell Host & Microbe/ f; D9 q E( {
1 z; P' K2 G8 ^8 u' r Cell Metabolism
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Cell Stem Cell
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Current Biology
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3 r7 y a. ~ `) ~- t1 w s Developmental Cell
8 M. e* n9 b, u+ o4 E
7 i8 m x N" [! V1 r Earth and Planetary Science Letters4 A0 `3 u# r% J6 V- x0 A
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European Physical Journal C
K5 M; U* M9 o5 S
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5 L8 @% g6 d8 ^2 f Immunity
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Inorganic Chemistry
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6 c- P0 f9 D6 ^7 N& \4 b Journal of Cell Biology
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5 |5 b: I" ]" Q/ c1 C- A0 Y% n* d
Journal of Geophysical Research: Atmospheres0 ^$ `, } [7 b" \" A$ g
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Journal of Geophysical Research: Oceans
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Nature Biotechnology
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Nature Cell Biology
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Nature Nanotechnology- a1 \% K+ e- n& p0 t) w
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Nature Neuroscience
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Physical Review A
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