2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。9 l2 m+ G* L, _3 d. @! D2 Y
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消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。
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3 c& Y. `, R& R6 l; c; g2 Q) X3 P 对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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N3 P# m i! K! O, l3 Z 2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。) n# W1 D' y) N( v" C
" l1 B* Z Z2 X1 { 根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。( \9 w, {. V' \9 f) T
) n1 |8 l7 |7 a- s% I 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。6 J+ E7 j0 ~( }( C* F( M
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。0 d9 ~# Q3 k' D9 a; J R, U3 A
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NPI依据的18本期刊如下：0 _ Q/ z9 M/ D6 T4 u3 w0 D
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Nature Cell Biology
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Nature Chemistry. O# p+ M. t( g C n+ h8 B
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Nature Chemical Biology
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* X5 C( _6 X3 C. a4 V* I8 N Nature Communications! @$ [4 [1 y- D7 U' T8 y
F/ o$ `: S& _% Z% m( k7 B Nature Genetics q$ s" f- I2 q. o8 r
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Nature Geoscience
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Nature Medicine
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Nature Materials1 k) D& X- m( F7 I
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Nature Neuroscience
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Nature Nanotechnology8 R! ^3 j1 @$ f4 C: e$ J
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0 C# U) j8 Q$ Q& K% r Nature Physics# w) r$ Y: D4 m3 N3 D0 W- W
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Nature Structural & Molecular Biology% Q6 d, W7 o* I& l
1 t% D9 g* T# s8 D4 k) R 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
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* n" @6 [4 H7 b6 J+ P NI依据的68本期刊如下：
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Advanced Materials
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American Journal of Human Genetics
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Analytical Chemistry
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Cell（《细胞》）
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Cell Host & Microbe: v) B$ l W: p: O# s
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Developmental Cell
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$ L5 i1 }" q% @ Journal of Cell Biology- i: b) E& a( i: D
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Journal of Clinical Investigation
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Journal of Geophysical Research: Oceans
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5 Q$ P# t1 I& e2 s9 E9 B" a2 Q- q Journal of the American Chemical Society G/ ?$ u% O( n% m4 Z+ |; Z
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Monthly Notices of the Royal Astronomical Society( U4 X# `( g( }4 y' h) k. K( N
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Nano Letters
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Nature （《自然》）! a6 |2 ^$ o* @) F! `$ s2 e% E9 q- G- m
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Nature Medicine
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Nature Methods
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Nature Nanotechnology3 M9 u8 Q# W: _% D+ G+ G
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Nature Physics6 s; e8 l# w& q( k, @* h" x
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