2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。* Z+ E# H* V0 K+ o# C9 m
( _5 A2 i1 J1 h1 T* D 消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。
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对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。: ]7 @5 [( d4 Z) l, z. K2 @ F
' t O% D2 c# t [5 V$ v8 C 2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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+ }" I2 U& @6 I# i3 v6 ?' x 根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。& |- k4 A+ V5 l* E5 X
8 j M N( z" t' d. U 英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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3 _3 Z0 Y u: V5 i8 S1 }( U% J6 @& ]' l “自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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NPI依据的18本期刊如下：
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6 e0 K. R6 \0 M4 g" A. ]; w
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5 b: ~2 x. R" O% s8 K' W, o3 Y( l \4 V
Nature Cell Biology4 j5 p$ E+ X9 `1 m0 A
4 W( y" P8 V/ C# ~* q. e! C7 L
Nature Chemistry
5 W, h( O& n, W0 `4 E- D& r' g
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. t4 b! }, P$ b* {5 U; ?2 q& s, o( _ Nature Genetics3 w& o2 _: n/ t5 g( Y- |+ _: Y7 X
1 ~, S% f: J4 p0 W Nature Geoscience
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Nature Immunology+ [; C( q G% g) u# {
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Nature Medicine+ K/ t+ \6 V, l& J* C2 i5 Z
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Nature Materials9 h% T+ E! c: c' N# H$ o
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Nature Methods
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Nature Neuroscience" M! ^6 @3 J# `* ] r
. i0 w- m9 x% B4 v7 S# a2 L6 } Nature Nanotechnology) @+ N' k: [! W6 O: ]1 N) q% L- {
* C' c1 u( R% ^2 i- f9 J
Nature Photonics
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Nature Physics$ K$ I8 C q, X; [
0 a9 z3 L5 ^0 V: X" V" \7 f Nature Structural & Molecular Biology
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而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。% i* N5 G" f v/ H2 @- ~
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NI依据的68本期刊如下：
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* i7 R9 a1 G* H( d Advanced Materials
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Applied Physics Letters
( p* e+ h5 K; Q4 o; s* B1 S+ y0 k+ q2 P( u& w9 }( y3 S
Astronomy & Astrophysics, r. s" u9 }6 o
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Cancer Cell. H7 t$ s0 ]8 Z7 b+ C4 r6 l7 t ]
* x1 z* u0 Z* d0 F& t, W
Cell（《细胞》）# V% f1 |/ X9 v2 H/ L5 B" F6 v# s% E
, v% w. r; r5 T+ ~+ _8 r Cell Host & Microbe
- |% s ?, J- h S8 b+ o4 X0 p/ L; V1 h( A
Cell Metabolism
5 f8 Z9 V6 e$ Y! M- O1 A$ c$ ?' V0 O. E6 [2 X; N' o+ K
Cell Stem Cell
4 ~& R/ b7 H4 `6 M5 i* [6 @0 X: e! J
Chemical Communications: a' S; Q) [/ G0 b- s) ]
% ~1 ^$ o& r' @8 w
Chemical Science
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+ z/ w. W! K& U( t: J' |% ?; C- U Current Biology+ a6 w8 y" t# d& `
* g- A+ i" {9 A* i1 f# x' [1 S% H Developmental Cell
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2 B0 T% e% F6 G4 A' @& {9 f+ }5 L Ecology8 z* w, ^+ v* J
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2 e, j& `1 ?$ h6 Q Genome Research. p8 f& Z2 r7 I
! t4 Y( {1 } _0 n Geology
* N6 `( r5 R9 m) J4 z6 ?1 T: T! O6 v- v
Immunity
; x1 j) C& V+ h: I8 v- [. |7 p' n2 `9 `
Inorganic Chemistry$ g; w. f0 h' a, q
; ^& V0 v8 f5 o, v) u: I
Journal of Biological Chemistry6 x0 S2 Y* a% @) b: ~( Q6 b
. G/ U4 f9 d3 ]& |8 N+ ^9 z Journal of Cell Biology& a* t* x2 _8 t' r$ k I) _0 h
b$ l9 g/ a/ M- ~# E8 k: G2 R2 {& k Journal of Clinical Investigation
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7 `8 ]% Q' Y; c. p2 C) w* b; m1 D2 q Journal of Geophysical Research: Atmospheres
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\) U( A& U- W; w5 n L" R" X& k8 a6 n( ]8 A9 c" r
Journal of Geophysical Research: Solid Earth! _- V; `2 h, t0 ]
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Journal of High Energy Physics
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Molecular Cell
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9 e3 t7 B/ d. w% ^: t( s! } Nature Cell Biology
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Nature Chemical Biology
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Nature Chemistry
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; Q' ?3 o3 O: I: } Nature Genetics- U. D+ M# [- Z7 M% g, A
: X2 U! [0 `" z+ n Nature Geoscience
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Nature Immunology( x$ ~$ \/ o- H: e0 f
8 s3 Z7 V1 V' L Nature Materials
. `7 L% u2 p+ t1 z
; x8 ], ~! ?3 Q Nature Medicine6 C9 Y$ O: r' f/ y) e( c$ b& t
4 H" }: f9 [3 l0 ~ Nature Methods
% L" w2 o* i; _' s/ a+ `
+ m$ W8 W1 O2 `7 ], f, F6 e Nature Nanotechnology
" |4 t. y* C# v2 x, d# X9 L. T% }! I( r u t! f
Nature Neuroscience
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The Astrophysical Journal Letters
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The Astrophysical Journal Supplement
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7 N; ~5 [2 ?$ ~1 Z
The Journal of Physical Chemistry Letters
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