2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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$ w3 i' u' x! L. W% T 消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。
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0 w; w7 c8 B! y- A( P$ W1 o; n& q 对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。/ p, [ P8 t+ a' _( r; g
, [0 ~3 T, o1 c5 z1 H 2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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4 M/ \$ J% b/ E5 v j- ^2 S- k: K9 @$ D' z0 O) U5 `5 n' G
0 O6 @# x/ f6 `; c( r/ |0 u 由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。7 A% v/ f. U3 U& r
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。 w3 f- [+ {6 z. Q# a8 r& l) }. @# d7 l
. C+ O# l9 e; u% R
“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。0 O' T: J |- x* |4 J
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NPI依据的18本期刊如下：
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Nature0 Q; @1 v+ z2 D- F( c) o
3 j; {6 w, X1 q g1 z
Nature Biotechnology
9 ?% `/ B3 b4 V. E' W& \% k" E
8 a2 v: @& |5 @, |+ i Nature Cell Biology
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Nature Chemistry7 B5 t; R; z0 v: U0 B6 W/ ]- M
7 F# U# k8 _! V4 E3 |4 X! f Nature Chemical Biology! l; I, D! W2 S
T$ i6 O5 N) p$ ], m* H
Nature Climate Change
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; [* ^ S4 T: ^- ]2 n! { Nature Communications. B/ I% D# _# I- |
0 Y5 y9 x% S: ]/ p( I; j: ? Nature Genetics
. s$ \; Q0 e. R/ p4 E
) O; ^& h8 _4 u8 {3 w S1 I Nature Geoscience2 g. Q$ T% U+ }. ]/ j
" C$ \8 m ~) Y/ Y Nature Immunology6 I! V6 P- h4 c V6 L
, {6 J* N' t) O' P+ C
Nature Medicine! |- f# P8 D# \/ F" ^8 V9 e
/ |/ b) N; b) A8 J
Nature Materials
/ C F& V( S* l6 x# D* f6 a0 ~7 c& {2 `; P
Nature Methods
& r% p2 k* G8 S5 M! t" P4 c* m) Y, E5 M6 I( u$ S) D; {. s% n
Nature Neuroscience# s9 A& e& s. O6 p! i1 ~) a6 q
3 c; ` H8 T/ i Nature Nanotechnology
6 Q, U( }4 B* L7 d9 g8 o1 K1 `. j" w
Nature Photonics! f( p1 \0 X% ]' ]4 ^5 I/ u
1 x' ~( Y% X0 W. G; M2 ~
Nature Physics
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Nature Structural & Molecular Biology8 Z; N, u2 T( H( H
7 j9 s: L! p& N# ^' b8 J0 L 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。5 Z# o0 o/ U1 s! D) w* D
; Z$ w9 s; y% r$ f( _* w8 u4 W NI依据的68本期刊如下：
9 ^& h+ }1 M5 @ S& ^2 S3 m, D1 g1 |2 y4 o$ }' i! _) ?( P1 K! b0 y
Advanced Materials5 Z6 O: t0 G$ Z" _# t+ ~" n
) E% S5 M# z8 h American Journal of Human Genetics3 \( |, G6 }4 S8 ]( D4 {
4 t I! x h: |8 _3 U Analytical Chemistry0 \" x* c" @0 L0 g r. ?
8 @$ q% h9 i# u$ i' c0 u2 K% o Angewandte Chemie International Edition
5 [/ l2 k4 X* A& p
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0 b7 B9 Z$ {0 M+ M, `5 F! i Astronomy & Astrophysics& M$ T) {/ v+ \! M- ]- Y$ z
1 f1 C8 ~" `5 t' X Cancer Cell
# Z! v# U4 t* T# U+ ~6 D# U, [! E3 p3 y u& e) N9 A
Cell（《细胞》）
7 D8 R0 q# [9 k) O( b
5 X" {/ Y0 n, e0 a) z Cell Host & Microbe- Q2 h4 ]5 V ?5 w( v A$ w
' I# S `; m6 |$ |3 w" p
Cell Metabolism
8 z' p/ K8 b8 @+ B( s- V- W) b1 o4 r% ]7 |* M
Cell Stem Cell: ^; L: K) m1 j8 j% L# \: n: }
9 N! T, }8 C2 Z3 j! l Chemical Communications
# R* k8 H) S9 g$ q* R
1 b# C; S U/ C! X. A, Q$ A Chemical Science! y/ V! T# }, P. w
4 ^8 j. g6 ?* h) P; C# Z m
Current Biology! Q% \8 X" ~9 x
" g" K* e* w$ a2 \4 @ Developmental Cell
F& x& ?! @3 I
) B* t4 {! s" K8 D+ S Earth and Planetary Science Letters5 C6 F6 O- x) {
# X8 O! n# D; u
Ecology
5 o J, ], ~ J- m7 z- |, i- n0 {) ?% r8 U! e1 l
Ecology Letters
3 s4 f, `6 F' V2 a% \3 Z4 Q4 g l5 w3 c- f
European Physical Journal C
( q1 z- ?. X1 y9 A7 \. J7 o; S9 I9 }6 @, d
Genes & Development0 g% [. P0 Q% v$ I/ v: u5 T
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Genome Research
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Geology* ~2 ?8 i0 V: }! k- |
. r+ n, x' I2 N
Immunity
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Inorganic Chemistry
3 ]7 ]' i/ h1 i1 ?% g* a$ _6 P3 x! A- X+ Z! p
Journal of Biological Chemistry
/ g! }% Z! k; z x1 N3 v5 z
8 b7 F6 |7 b, R; p2 ~ f Journal of Cell Biology
% R' M9 u9 _: f' q& b
* M. c) Y) @4 W, x; N- r; `- [( B Journal of Clinical Investigation! {' N# k1 S7 S
* S7 t# h. t- N" L, X$ B
Journal of Geophysical Research: Atmospheres
9 z X6 p" V( ?
; O4 r0 e7 x8 X4 }" \9 o Journal of Geophysical Research: Oceans
: X+ X, ?2 S$ b& C6 _
$ l0 I# n2 \3 x4 S$ l Journal of Geophysical Research: Solid Earth8 V: r4 {& ?. ]; @) Z3 M
8 Z$ V/ P0 F8 m. l Journal of High Energy Physics3 ?: E0 {7 }0 p( o
2 K; O P4 T# l5 i+ h Journal of Neuroscience3 G7 G, s6 S; {9 q9 ]
7 U# d* j# k# b# r
Journal of the American Chemical Society' t1 l0 ], P$ j/ S6 x
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/ ~8 D- y& l p5 C& F3 f/ N1 m/ ]& K/ B; p
Nature （《自然》）# G! i( I* q& k& R
9 L! j3 {1 G, s) {1 H
Nature Biotechnology
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4 S# Y; v$ Y% J K7 `" H Nature Chemical Biology
0 a2 F9 N9 K% L2 F$ Q0 l( n E- ^) f% F
Nature Chemistry
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Nature Communications
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- j7 ^0 N! g2 N) m% r
Nature Geoscience# @/ w- h& ~; V( |* m) @7 ]
! a* G' u% e% e8 G7 _9 C! E7 q& P7 p Nature Immunology
9 c5 m4 e w# d3 F" f* s1 M
+ T! L/ `$ L# Q: {9 s% p& { Nature Materials
- Q/ \! g7 x; X% P
9 M& B* a( h2 g7 ^ l" x f Nature Medicine
' K! G: S4 o9 ]7 {
, U1 a* x# S d& _ Nature Methods
) l, D9 {! E5 t Z0 d4 N7 H+ |
' h+ l$ T. m; @ Nature Nanotechnology
2 |) L. q$ j3 B* O9 K O9 c* p) I6 h4 J# q7 k" E% ~) O2 Y {# R
Nature Neuroscience
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' W4 a0 l" g" Z0 K/ W. b& z) D. m Neuron
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Physical Review D' ]# s5 x% y( X5 M/ o7 e9 \2 y, J
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Proceedings of the Royal Society B
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$ M3 K. S# x3 V6 P# u/ X- }/ I The Astrophysical Journal Letters) [% ~0 L% k8 L9 a) Q! e0 e
: m, n4 [ t, r7 _
The Astrophysical Journal Supplement
6 X6 @5 H; r9 {& F' }( s/ A; p2 {; m q' u- v2 O9 ~5 G4 y
The EMBO Journal2 l, V) G& [8 g( G: `8 `
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3 \9 m! |& h5 `: c6 W4 f" G3 a, \: d) c) }3 e$ z% {( N2 y
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