2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。8 g2 h G i& Y7 m* P4 i
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消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。' l* s% ], B8 ^
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对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。 n" g c8 W6 i* o
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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2 d/ L2 k$ d4 F: x$ \ 由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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: s2 W) {) N: H' `$ V 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。7 _, H& k0 c; |( h& q7 v& M" B
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。2 i" {) G. {* x+ A/ b5 I
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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/ E0 r9 L2 p, q. n/ J' z& Z NPI依据的18本期刊如下：( @ f n) T7 q4 W; h( Y( M6 E
3 |+ Z3 O1 Z4 [# G+ R! Q Nature
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5 I p# K: x, h: ?0 F# c0 r Nature Biotechnology4 v+ ], }/ J% N9 q6 J0 O
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Nature Cell Biology$ d6 Y& S8 j9 C( c9 e" h6 U
4 m' S) c# W: @( ]2 U$ Q% @; s( Z9 T
Nature Chemistry
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2 J ]2 E+ c) G/ Y* _ Nature Chemical Biology
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Nature Climate Change
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Nature Communications( h0 |( w" m& f: ]: a8 R- w& ~
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Nature Genetics
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$ F% s# x& ~' O' y* ` Nature Immunology% v4 Z' A0 n# q- l' }# Y
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. a& C- I1 y# _ Nature Materials. l* C! d8 O7 \
' n& Z( V7 l3 T4 l7 h' k
Nature Methods
5 Q; m5 a X7 s ]3 P" d: d% p" U9 i; x# e5 L5 z% u' @
Nature Neuroscience
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Nature Nanotechnology
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Nature Photonics, j$ H6 c" ~" e$ U
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' x: c5 P2 ?" c4 S8 f Nature Structural & Molecular Biology
2 H" s7 K0 h: o( Q- b! d+ {0 i+ Q7 S9 ]. T# q
而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
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NI依据的68本期刊如下：' Y0 t P% V" Z$ z) X
5 D1 U( x0 k: S+ U; T( O Advanced Materials6 A' P/ y0 l2 a6 D
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American Journal of Human Genetics
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Analytical Chemistry
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Astronomy & Astrophysics
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9 ~! l1 p [$ E; B9 c9 }' ? Cell（《细胞》）
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Cell Host & Microbe
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Cell Metabolism6 N$ V/ [; R+ [0 o& L
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1 n3 F- L1 h3 N1 h Chemical Communications
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Chemical Science/ X, ]0 P3 G; E
) b$ [2 `% F7 _5 h! _! K+ Z2 U7 t i Current Biology
6 E" U$ g" y7 a. Z1 l" ~! J! O. b) D, W$ ]" R
Developmental Cell
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Ecology Letters' ^' d) A# j# W4 \3 b# W9 e' b: I
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European Physical Journal C
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Genome Research
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Immunity5 h% m' b- a: a1 e9 ?
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Inorganic Chemistry
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Journal of Biological Chemistry/ N, t) q' c) p: W* H- @
5 }7 R% }, o5 c$ u4 k& \
Journal of Cell Biology
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/ n5 W) ~1 o4 F5 q Journal of Geophysical Research: Atmospheres
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Journal of High Energy Physics
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Nature Chemical Biology
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0 `3 f3 D' ?( ]6 F4 J Nature Communications1 k- x+ D- d4 n. w9 E
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Nature Genetics
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+ f" P$ O* {. G% f) W Nature Geoscience; t0 k' j3 S1 l m/ f
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Nature Immunology3 I7 i' E4 p" s+ G4 q) j& y
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J% P$ }. b" G3 N Nature Medicine% Y, K$ J! v7 h4 O) g. E. M; V
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Nature Methods
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