2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。. Q9 t7 L# p$ l9 h. e6 s
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消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。: `$ w% r6 d, l. _' D
9 B6 {' c+ a- b7 x' U) R$ G 对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。* J9 ]$ n% B! E
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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8 ^" a i, a0 X4 Y1 ]& z7 P 由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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8 Q1 _4 C, O% f/ ~. v8 y3 D, j6 M 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。# d( y) B; w! B' G; B' l: n0 N! T
$ `8 U3 m, o" h0 D+ T5 p9 w 英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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% }5 g* {* W* m" M% t! I “自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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# O: c" ?, Q4 }/ m- t( [' ]) a NPI依据的18本期刊如下：8 D- V: c4 B% d, j2 W' f+ d
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Nature: W9 K/ N3 {3 Y" f( L
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Nature Chemistry
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Nature Chemical Biology
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Nature Medicine* v: S# a; A) j( Z
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Nature Materials
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Nature Methods) ~7 P, s6 V: X' j) f6 E
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Nature Neuroscience
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Nature Nanotechnology
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0 w8 o4 z* r% V3 e/ |! j! z 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。- E5 V- G0 W8 R& z$ c
4 G0 S$ z* s; o+ Y) M+ X NI依据的68本期刊如下：9 x/ {, t- G7 |6 s1 G
7 r: ^) r3 x! I7 |; k Advanced Materials
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American Journal of Human Genetics
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Chemical Science
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8 j* z: w9 h- k2 F: J Inorganic Chemistry4 h5 [2 G" |- R
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Journal of Geophysical Research: Atmospheres
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, o, F C1 x3 Z. C Journal of Geophysical Research: Oceans
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Journal of Neuroscience; b6 L" O4 x3 r% a: J }, o
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Journal of the American Chemical Society
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Molecular Cell
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2 V, o; U4 ?# F4 W& S" ]+ h Monthly Notices of the Royal Astronomical Society4 W4 k: o: A+ r5 d
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3 o$ C# w. @% x. Y Nature Biotechnology
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Nature Nanotechnology
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Nature Photonics- J# c; j$ }) F6 j% `' C3 j" d c& x
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4 x8 d' X3 Z! Z8 U Nature Structural & Molecular Biology
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Neuron! @/ I: v( w5 B* @0 v
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The Astrophysical Journal Supplement
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The EMBO Journal2 f1 ?- T: b" r! h# j4 R( h
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