2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。
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* C. v5 U% X2 C 对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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8 _- w& i2 _; [' m 2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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A* W* Q Y: G4 N U; Q6 g3 ]* j/ l8 o
由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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0 E: ]' Q% Y3 l, E6 ?3 q- |: p) e! {/ X 根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。6 U \" r1 N$ A. j8 b4 _$ L
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根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。8 J& J( n* k$ o. \7 B
1 V% h# Q# g3 F 英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。: z6 Q8 H8 _: N5 T7 Z
& C) ]1 n% K9 _7 v8 g NPI依据的18本期刊如下：" M' E9 ]4 D4 O
( H8 _1 b- f) m- [1 c8 ^3 h Nature$ h9 G. j+ Q+ E( ^( m; K
8 a }& B9 B; g* M Nature Biotechnology
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Nature Chemistry
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Nature Chemical Biology
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Nature Climate Change
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4 H3 R5 m8 ]5 m Nature Genetics+ E2 T. Y) l8 i
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Nature Immunology% ^$ U. @# h0 P4 N0 G
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Nature Materials6 |0 n& j6 h7 ]# G
5 o1 E" ?& {: L4 I Nature Methods# s: Z+ N0 y+ d5 g: D) Z
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Nature Nanotechnology! J. @$ D% c6 L6 x7 F7 @1 K4 k
6 ^5 X/ S# Y1 }! n p5 J& V Nature Photonics+ R( B* \0 B$ ?, J& K. _+ C5 c3 e
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- S5 o! ~" }; b4 T/ Z! S: v5 f Nature Structural & Molecular Biology5 g. o4 B3 f: g6 {
! V, }! s3 g* `1 A 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
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NI依据的68本期刊如下：9 z. y+ f, C1 b+ o
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Advanced Materials/ k# m) c2 Y, S: ~+ {7 F f* Q
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Analytical Chemistry
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Angewandte Chemie International Edition
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Cancer Cell
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Cell（《细胞》）
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Cell Host & Microbe
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Cell Metabolism
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Cell Stem Cell
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( U9 ?: y# D9 Q7 q4 x! d4 w! l Chemical Communications. t$ ?1 s4 e# Q4 @' z) P
$ e: f1 P- _2 L Chemical Science
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Earth and Planetary Science Letters5 c; \: `9 q) A% w0 a6 [$ ?+ ]
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$ @9 C3 j; M" t; p
Ecology Letters
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European Physical Journal C
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Genome Research
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Nature Chemistry4 q% H0 ?6 q4 s* m5 c
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2 \5 N+ M4 m. q q& ?- W% M Nature Genetics
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The EMBO Journal0 W% n, Q. i( ?
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