2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。8 g. {* v( _* w; i7 {( X# z3 c
7 a2 |) M2 g6 [3 P+ a/ x. l' m+ Y. v
对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。2 Q$ j$ V1 e4 q0 c+ F% a; f
/ H+ e* w0 ]( R1 E 2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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6 R, [ N) h* p- e 由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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W S, ?5 U0 J Z- T& Z& r* @ 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。6 s {" ^* ^1 T6 \9 R; j0 e# _
. @! H% D% d7 W6 O0 d1 r/ O3 A 英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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8 J6 }* H& h& @. L1 ]. }/ o. y “自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。' h- h4 U0 u( E1 k% g6 s9 Z
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NPI依据的18本期刊如下：) \8 ?. W0 T8 H: v; B' h9 f
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Nature Cell Biology. Q2 k% ]* `! j. y U5 G
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6 x: W) e5 j/ E Nature Chemical Biology0 L M8 k: p i6 ]$ t
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Nature Climate Change
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Nature Communications
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Nature Genetics7 e4 d- E# v) c9 O8 E/ l
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Nature Geoscience
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Nature Immunology
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Nature Medicine+ x; i1 d2 T3 U
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Nature Materials F# Q7 V( S; M( N" d2 x' \7 f! \! l
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4 a8 O5 W5 L! H+ J2 Z' V0 e Nature Nanotechnology: J; k: U2 |" l+ K8 g
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Nature Photonics A& |# @ n4 }4 C
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Nature Physics& t6 T* x$ f# I9 U. y
7 R/ V" l, X1 a# U8 h" D Nature Structural & Molecular Biology7 X* J/ f' o6 C: w0 z
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而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。' v9 M. w, D& `
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NI依据的68本期刊如下：: e9 f- z5 E- d" H( p$ E& ~$ |" H5 Z
9 p. n( F2 ]+ } u' s, t Advanced Materials% v1 \- ^& \/ H8 [( X7 j' g
* i4 Y; i( N* e American Journal of Human Genetics
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Analytical Chemistry
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Applied Physics Letters
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8 ~: C7 \1 r6 h1 x( S Cell（《细胞》）
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Cell Stem Cell v. _/ P2 u6 b. y& v% J0 K
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Chemical Communications- j* @5 a# j6 j3 ], j
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Chemical Science
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. ~- E% Q/ X; @( x! Q6 L( L Current Biology
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. t8 R$ D2 H' Y% x# d Developmental Cell7 f7 A; c6 [! w
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Earth and Planetary Science Letters4 q- [# }3 g1 s5 a, h) X: N
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Ecology
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" y/ g3 q4 r$ @( F3 n5 v Ecology Letters
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4 r, t s$ f7 k1 h
Genes & Development6 Q/ C" F! V* B+ h8 ~ }% l
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Genome Research
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Geology
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, u% K S3 E0 l" x% p2 K Inorganic Chemistry
8 B1 p" n& V! T! a! I( Q/ S/ O
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. A3 y( B8 @1 r% }( \
1 r* U! ?; y2 u5 M' M Journal of Cell Biology
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Journal of Clinical Investigation
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Journal of Geophysical Research: Atmospheres t( p, p- y4 K ]; P
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Journal of Geophysical Research: Oceans
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Journal of Geophysical Research: Solid Earth
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Journal of High Energy Physics+ z- \; A. d/ d" P7 O% X4 b# N6 w+ f
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Journal of Neuroscience
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" p' z$ ]: B7 w T% Z6 k Journal of the American Chemical Society6 _$ c' C$ T" t, c) Z
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Nature Biotechnology
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Nature Cell Biology
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Nature Chemical Biology$ j; X* E9 p' W
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Nature Chemistry
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7 y8 `, R& }; w Nature Genetics1 d( n$ E5 V- ]. Z
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Nature Geoscience
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* i3 q# _& i1 M3 g _ Nature Medicine
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Nature Nanotechnology# F# L% ^; j. X3 i
! g! [, j3 I7 `4 J1 x: c; d
Nature Neuroscience
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Nature Physics
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2 ?/ p" q& |' ] p
7 J9 W8 y, k. C# G. N3 g Physical Review B
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$ E# k$ y5 m' y1 O1 G3 j. M X* }/ L& `0 o7 O+ Z
Physical Review Letters
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The Astrophysical Journal Letters
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The Astrophysical Journal Supplement
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