2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。( S J) W8 R1 f1 n
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对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。) Q' g, W/ U" \4 K6 l" r# r4 ^
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。# h, k, t: D. Q" _
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7 j: y' ^: Y$ o; P3 G0 E2 O8 z, \ Z8 B5 K! \
/ `! [ _$ E/ N* ^9 v w 由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
6 D2 P) b0 E" C& N2 L0 A# b# W( w& t
# [" u$ O4 ^3 z 根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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. H m: h G, A5 X* {2 N 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。
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/ J/ A. e2 n: ?) M S# k7 N1 ~9 Z/ d 英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。 J4 a+ i0 c- [' l
' B) l0 Q4 B! ?0 D1 Z& k
NPI依据的18本期刊如下：
7 G' R0 c6 S1 e v* ]
/ n5 g: C" q4 J: L Nature
* J5 Y. G, @: N% ^/ g. e) [- M: ~4 o; Z6 ^, O
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Nature Chemical Biology1 Y ]# c' v# {
. x6 R; R* r- X! T+ b
Nature Climate Change% v/ u8 v" [, x
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& X6 I) G$ s* q/ T9 n4 J U8 ~2 z Nature Genetics
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Nature Immunology
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; W9 M5 \- j& k# \/ c; h/ ~ Nature Materials
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Nature Methods% y: p( Q; Q; X% {: I" ]( M* V
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Nature Nanotechnology( t) ]/ V4 ~0 b8 [
0 U! M0 A7 w3 k; D( O7 X# J Nature Photonics
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i% X d5 C/ w Nature Physics6 A5 L2 B1 V4 o; d/ G5 R
( P7 j. H8 Z; S- n Nature Structural & Molecular Biology ~& [( ^: a; w
, B4 i4 t& F4 }6 O- w9 a
而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。1 d" f' q* G$ Z( H
7 E$ n$ d7 d. o0 u; d( l; ]; F0 L
NI依据的68本期刊如下：
D9 B% C d5 j2 w: ` q( c" [4 ^; m0 ]# V$ s7 H
Advanced Materials
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American Journal of Human Genetics
4 q4 ]# `; W" o; N8 K6 a, r4 D! F
Analytical Chemistry
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Angewandte Chemie International Edition
4 z& J+ V/ b' y/ U) g& e0 }; [6 m; M) c! T1 i1 c. \* Z' |
Applied Physics Letters
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Astronomy & Astrophysics
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6 R8 V/ n8 T3 ~ Cancer Cell8 t9 N# p5 j2 U$ v6 T3 L: x
$ @; `" ?) l# e4 A0 X. ^
Cell（《细胞》）
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( c$ @% k; b( c' S, | Cell Host & Microbe5 Y. j( j7 Y" j* S. J
8 J& C# W6 p( V4 ]% } Cell Metabolism
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" ] V# m7 U5 @ Cell Stem Cell
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- \1 m6 J: [+ _ Chemical Communications
- o; ?: J. g9 K: [/ m
) I1 Q# `& k8 x6 A; @, I. @' E* z/ t Chemical Science
, d! h, A: ^+ r- |/ F( A
n( L$ O' X, G8 U) \8 Y Current Biology
# M: q& O4 W3 k/ U4 C' M4 I5 N# X" e& g) H0 I8 T, Y6 C
Developmental Cell
; N; d) e, G' @
8 B1 K6 B; P4 Y W, R r Earth and Planetary Science Letters
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, x0 ~2 I( \2 z# J7 B Ecology
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Ecology Letters
3 x& W: y' ~- ^' w# p% x! F1 \5 M
European Physical Journal C
2 K& J1 Q& W6 D' U& I1 Q% l/ t$ y
Genes & Development7 s. B( `2 x( @: e: {* _
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Genome Research
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, U0 o/ W# y. d# F. d2 k Geology
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Immunity
1 y" F4 T7 n( \5 r! u6 A, f5 N8 ~5 ~/ u9 t
Inorganic Chemistry
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Journal of Cell Biology
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Journal of Clinical Investigation
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Journal of Geophysical Research: Atmospheres
- y4 S% P$ q1 l2 h% T' Q, w/ Q: M7 `! M3 U! s
Journal of Geophysical Research: Oceans( y1 D3 s/ e( `' W8 ?* e
; N6 \3 m( a8 i# }. b5 P
Journal of Geophysical Research: Solid Earth! y" X; e' a( I+ V! Z
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Journal of the American Chemical Society2 v+ k" M7 i/ i9 S) ~
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Nano Letters
- z! q: T# K6 h- {, y+ o: v3 p3 ^
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Nature Cell Biology
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Nature Chemical Biology0 N% D, j j9 k9 Y* |. c" w2 J
* u7 c4 |3 x1 |7 c/ Q
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H4 j( H( [# `3 I" L4 o Nature Genetics
8 G9 P! \7 L# o
% d7 N1 z6 [$ x0 d5 M' x1 j Nature Geoscience
7 L! l' S" N9 v9 y% {. e2 K& |7 z6 q" \: U7 c2 u
Nature Immunology" w5 X( S6 z* e" S$ F1 Z' R% [/ j
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Nature Materials3 d$ z8 r6 O- M/ D
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5 k2 I% B* L2 h6 o. o( M* U Nature Methods
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& h7 x8 i4 G2 z, h1 V Nature Nanotechnology: g, X# R2 U( A# @
& m* D5 P2 U) B2 @ Nature Neuroscience" j2 i4 M; w: t
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Nature Physics
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' M" j- Z7 m' t& Q$ _9 D Organic Letters8 S/ Q7 w; ] e+ X8 ~
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Physical Review B
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Physical Review D+ g5 {; v& A) `6 n$ ]% Q) R. o
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Physical Review Letters
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Science （《科学》）
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+ Q. B7 Q% }- F! ~1 {* V4 p" ]& r1 L# B. \) a4 b
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