2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。3 w9 I% b& Y( v) U; S/ _3 |
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消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。3 w7 _# I7 k; ^
7 b' m2 w' I% g4 f2 b/ k3 } 对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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- K8 F# h# J5 b" o" P 由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。 n" E9 |4 A0 X( } F% E$ `
- f/ A6 v8 k& d: K; S 根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。. v; l7 d/ p5 x4 I
6 M7 P" g5 f6 `8 U 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。/ V {! i! V/ ~5 X+ X
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。1 Y: ~5 r% p$ g. d9 c
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NPI依据的18本期刊如下：) {: Q; _, {2 y
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Nature! h$ A: r8 g' d9 t+ _
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Nature Biotechnology
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Nature Cell Biology4 P0 D2 v9 g% g) @
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Nature Chemistry! `$ q0 }3 D$ ?, q
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3 x1 ]) z9 M' P/ f8 Q4 K: }" d* L Nature Climate Change8 f2 N1 ~& U* c( t k
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Nature Communications) |, R8 o3 f4 \
5 W0 z! v; l, V& q+ L
Nature Genetics2 B8 _" t4 O' q- T
- m# O4 b$ L# [% H$ o0 J" J4 M! G
Nature Geoscience, d4 B( @2 \: E( v2 k0 {! {! m- j
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Nature Medicine' [, Z# ?, V4 y) @
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Nature Materials
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Nature Methods
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Nature Neuroscience7 w, W5 g) y! i$ O' y* _' y
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Nature Photonics! E, s: P' u: C! n' H: v: [$ {
+ |6 P& c2 t5 V8 _- ~4 B, I: S Nature Physics
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& L t0 g- h9 ^; C' Q% Q, V+ S! T Nature Structural & Molecular Biology
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而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
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NI依据的68本期刊如下：! Z! {. V/ O- @( { k- z+ y& M: Q
" e6 ^( \# p2 L) }/ i# i: h3 ` Advanced Materials6 z( I4 n: R. S6 X( C1 x
8 h! q) K5 {! ^- `) I4 _ American Journal of Human Genetics% T/ u4 A/ M- k' w% L- u9 P" I u$ D
5 U. }$ p1 O3 j- X& M1 E9 S Analytical Chemistry
( d( @, Y, U( c, [) G3 @4 V$ h( \8 w
Angewandte Chemie International Edition
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- o' L1 r$ [* z( \/ Y$ G2 b Applied Physics Letters
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Astronomy & Astrophysics8 E" i4 R0 H2 u/ P/ S5 L5 [. r K- F' w
6 p/ _+ w1 Y+ k/ }3 j; Y
Cancer Cell k% z% A5 \2 Y3 W2 L$ L
6 V& Q* I! K; Y, @+ I' H% J; `0 Y Cell（《细胞》）
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6 R2 M6 r2 P% e. F& X. _ Cell Host & Microbe
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3 _9 W# y6 Y w$ Q Cell Metabolism
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Cell Stem Cell/ C! I8 k+ H6 ~! a# [, b- l
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+ H7 X1 G( A8 ?* \0 P3 m% d! j
Chemical Science: ]8 U3 a- o5 C$ q+ s8 _
1 j& ?. S4 A( P
Current Biology
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1 U4 p" _* d; Z! {% a2 r, g* J Developmental Cell6 K" y" Z. y+ W- a+ c9 {
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Earth and Planetary Science Letters
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Ecology' h2 \$ C+ \7 a% s
: U; c, A9 v: T7 Z/ {1 l
Ecology Letters
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1 S1 [5 c g" Z European Physical Journal C9 H" E a0 q, V X1 }/ F1 L$ j2 g
. a- I* B; y' r2 @1 f2 T- E Genes & Development
2 H/ |# b$ K# j( L& ~) |' M4 u& l) _* p( D
Genome Research
& u4 P9 j8 h. W0 x& h0 P& g; j5 e6 S \% t, s
Geology
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Immunity
7 W4 c9 T5 n% J; L V! ~
- b2 p! o4 L4 i, y6 X Inorganic Chemistry
( K X7 Z" F$ P/ Z+ h: w9 O' d5 ^2 k3 A2 `% L6 k) z% G
Journal of Biological Chemistry* L8 @: d$ Z( I) ~! M5 ~
1 B3 ?8 R1 ]! E2 [8 K2 f* r: ]" K Journal of Cell Biology1 Q1 W) n$ Q- I# X0 H# ?, R
( ~4 p1 r0 G, J, c Journal of Clinical Investigation
8 m# F U9 I( s' g+ x- }8 I) j5 z; Y
Journal of Geophysical Research: Atmospheres
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( W- _$ M) }, i0 J7 x; ] Journal of Geophysical Research: Oceans; C4 r5 T" e( s# ^
- Z+ I+ g; x- z% M, c: v: Y
Journal of Geophysical Research: Solid Earth
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5 z3 b3 U$ t' W- O, K Journal of High Energy Physics1 z+ V/ I3 J' L# S0 m! Y
: Y$ v0 G; g K ~; c' k. a3 T Journal of Neuroscience
. N5 p# k' M2 m, o- y. T T! ? E8 `0 I2 ]' f5 D+ k% Y
Journal of the American Chemical Society# ^( H4 [5 f) u1 D
* s; g q, D$ J Molecular Cell) C V* D4 ^' Y0 q! \
3 I) D. W; c8 T+ t; h4 ^: K
Monthly Notices of the Royal Astronomical Society
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- S2 o5 b0 R2 A$ W+ l Nano Letters
- A0 \+ G+ ?2 d9 ^& _1 P" }; Y' n6 e2 `; B9 r; K) ]* ]7 V/ u, {% J
Nature （《自然》）
+ A& r) ?* [! o- Z" I5 D( p" ^- t9 ?5 N" Z3 q) N+ v/ C! d/ k
Nature Biotechnology
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Nature Cell Biology
/ Y) A; W8 c$ F, N( D: R$ ]) }
5 w$ H8 U3 D8 s. ^5 y0 K$ T7 I Nature Chemical Biology( r* G) D. t& |0 ]; c$ Y
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Nature Communications
& n( q) ~" v' l6 l, E- C1 M& T% z9 I9 L8 l4 E1 I
Nature Genetics1 ^1 ^; E1 ^3 X4 y
6 G) W: j7 M$ I7 d0 w- u+ {
Nature Geoscience
- a7 ?1 K5 V/ x6 C3 C4 L0 K4 f. w% k: |7 j
Nature Immunology: }! Q5 M& r! r M7 b" L! L. _/ w* b9 ]
6 g% e9 q% x d, T4 H Nature Materials+ ^. \/ u1 e P* _: Y2 m: b
! n. g/ t8 Q* u: k
Nature Medicine
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7 o8 i b1 B; |- u4 f+ Q Nature Methods. W0 h0 z1 D, l. N; |5 Q
* m1 d( g; @/ p: W! R5 _% ~5 K
Nature Nanotechnology8 Z2 t" S* z- j( Q
5 P$ x, F6 g3 t/ x3 O$ D! C Nature Neuroscience) c# k' h h4 `
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Nature Photonics$ {8 {: g( t' R! p/ R- n
8 j' k' s; \2 r& `% }9 ` Nature Physics
+ t$ G0 _$ ~8 m' G7 T/ z H! M
5 b# x: R# W8 e0 I Nature Structural & Molecular Biology
1 q3 I3 O9 d6 ^# |& `. O( S
$ m( T+ ]/ e1 j5 G. x1 r Neuron
' V) i+ M' O0 E: z
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8 T, }5 ~1 h D8 T) g
PLOS Biology' b' i5 @* c6 s
/ R) a; `, }0 j5 H
Physical Review A
* K+ U3 E( g6 W" A1 R2 s9 B! x3 A% o( y
Physical Review B
& H7 W- ]/ z; p U: A* T: B0 d: y: C2 _7 u
Physical Review D
: Z! F& c+ \$ C; s9 d/ U- b- y/ @7 i2 P
Physical Review Letters
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Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
# [# I9 @ b5 d2 L, ]& i6 X, k/ h
$ \: u7 P( N: p, l& y: ]1 L+ R0 F Proceedings of the Royal Society B. O* ~8 g+ a D b1 x, x2 E
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Science （《科学》）; N# X5 |% x; H- v# X
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, T% o- s% q* R+ y2 v& c4 O The Astrophysical Journal Letters
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The Astrophysical Journal Supplement( Z9 \: E5 G- w- @% F! ?
* P$ _! O3 a9 X7 T: k5 H8 L4 K/ [
The EMBO Journal; l3 A S+ p+ O" G! \2 b
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The Journal of Physical Chemistry Letters$ H5 `. K+ @3 [2 f
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