2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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& O: R2 H, U$ N 消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。& W4 S! [+ u3 t/ N( @$ I7 ?- q1 o
9 A' c3 M# y1 P
对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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( T7 U/ Q/ A! T 由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。2 ~" }2 l" Q, l
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根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。( J5 O! [* @2 c7 D1 [- W. Y
" H O; R5 v9 S: @) a6 J 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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4 {! N% `" S' V “自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。8 R# u3 H; l1 k7 @
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NPI依据的18本期刊如下：5 r- n3 Q9 ^6 l/ d% l) F* ?9 O, _
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Nature/ n d X, f5 J* f5 s; u
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! Q0 B, [. c2 I3 Z Nature Communications7 n. Q9 k$ y" z
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Nature Geoscience
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Nature Materials
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Nature Photonics
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Nature Physics( `+ V* i1 ~5 k; s! L7 J B r
! J1 m0 G4 ~! o, |- w Nature Structural & Molecular Biology
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+ ]+ [9 B$ {8 F5 a$ f/ B 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
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NI依据的68本期刊如下：9 u: V+ i, D6 s/ H1 P
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Advanced Materials
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American Journal of Human Genetics* G1 I; _. @. V1 O$ g! V
7 r. n9 L/ g# ~+ F( P Analytical Chemistry
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Angewandte Chemie International Edition
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5 S% H7 ^) o3 z$ e+ _+ V8 ?" s4 k Applied Physics Letters5 O9 M' X; S, S& O
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Astronomy & Astrophysics
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# f5 a, M6 O: l5 ?) V1 w } Cancer Cell
' o" A# t9 n, ^* Q3 V
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$ c% Q d( j" ]) P Cell Metabolism
6 m: X' D7 y; e% j+ n& G9 O& q. }, S) n' [4 Y7 j
Cell Stem Cell
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$ K6 ]3 _& Q: a8 ?1 F, h" d Chemical Science$ W- \7 l% w; C
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Current Biology2 _6 u# O3 z" a) U4 b1 E
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Developmental Cell' |7 i' Q7 I8 H- F
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Earth and Planetary Science Letters% l, k5 k' F9 | Y" \ H$ M) O
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Ecology2 t' ?) k7 T( X& Y0 U3 s, Q2 }
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Ecology Letters; j0 D* d- E7 E# ]2 L
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European Physical Journal C
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Geology+ W2 U7 X& I G
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Immunity8 l1 Y g; Y" k
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Inorganic Chemistry
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Journal of Geophysical Research: Oceans- E; |. p7 ?$ ]$ o: ^2 h# E
! z* |3 x% I# Q1 \6 W. C1 ~5 }( d0 G Journal of Geophysical Research: Solid Earth4 e) ^ C+ F: n1 R8 P) ~3 G
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Journal of Neuroscience
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Nature Immunology
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Nature Materials" ^% T* Q O) X6 i8 P- g v
& Z0 o' u" m" `+ T$ m! _7 ?9 p& _ Nature Medicine
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Nature Nanotechnology
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Physical Review D
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