2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。& t( [/ J+ _" T, Y6 ^, A
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消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。8 j1 k" y3 U$ y) v) g; l( {8 ~, d
2 M: W0 ^3 q) F+ |0 l
对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。8 p% F& B c% H r) `
& u( M: Y! J5 H 2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。+ h. V) {9 U$ Q v
1 M/ {3 |. z% `8 ?- t/ |" Z 根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。3 q. e4 `% T0 D: W0 o( F
+ R, ?; P Y3 n3 j, m- K 英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。) c/ Y& ]& l p# ^" L
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。/ P5 L6 U; P4 y; b
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NPI依据的18本期刊如下：
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7 R! Z4 c) [& A" r: H# F N# T Nature
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Nature Biotechnology
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Nature Cell Biology# y0 e" S4 @) V" P" F
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Nature Chemistry
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Nature Chemical Biology# n0 B* L& Z2 D& g) k/ |1 U
5 |# O& l# A, R8 M Nature Climate Change
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Nature Communications
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Nature Genetics, H9 |% w M7 o" w! I4 E9 V
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Nature Geoscience( ?1 p0 f- M6 b$ S: V0 c9 P" b2 {% g
4 _ ~; Q+ d, l" d( k3 }9 i Nature Immunology
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Nature Medicine9 y2 Z5 o4 M* Y$ y3 J
& i! W! K a, R( C4 W Nature Materials0 e' L9 x' e* ?+ Q1 K
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Nature Methods4 n* }5 h* N8 i: O& x1 n& O) A
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Nature Neuroscience
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Nature Nanotechnology
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Nature Photonics4 a$ H4 M- N) [6 o
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' m2 \; r5 b/ r Nature Structural & Molecular Biology: [: b% p6 [( @9 a! g. b( U+ e' \
, [( Y" h0 x5 o2 G# Q$ e9 s 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
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' b( Q: `6 D; R9 B' a NI依据的68本期刊如下：
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Advanced Materials1 v! Q* J- w8 ]* W9 m6 F! j
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Analytical Chemistry* A% y# M5 W" a" [
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Angewandte Chemie International Edition% E2 b: _# v) r7 N
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Cancer Cell
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Cell Host & Microbe: B- G: g8 I! R
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Cell Metabolism
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Chemical Communications. C) q' V; z: l( w! T5 ?$ i
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Chemical Science6 M" e# N# y8 W X2 V
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4 G5 F& o) b& C; U1 R ^% G9 t Developmental Cell
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Ecology Letters
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Genome Research
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Immunity
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Inorganic Chemistry+ C7 C$ n+ q2 d* t* N. W
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' C5 ?5 P/ O- S9 y( _. K
Journal of Clinical Investigation
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Journal of Geophysical Research: Atmospheres
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& `% K: ~/ a4 X; {5 z+ \ Monthly Notices of the Royal Astronomical Society
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8 c% X }3 }" M Nano Letters
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Nature （《自然》）
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9 W) k8 C: f2 r* b0 E$ @$ H Nature Biotechnology# r0 E: s4 j! u
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Nature Chemical Biology5 L- X0 H" V% v3 X' g
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Nature Chemistry
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PLOS Biology
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Physical Review D7 ~& `# S2 x2 q6 E
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Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America- u8 U1 S. d: m7 R( S
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Science （《科学》）4 s8 z! R% q* x8 e6 V P; L, Z
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The Astrophysical Journal Supplement4 A! W! B9 b, k6 G: i
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