2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。6 w: t, {+ b$ M$ `+ C
% X- N' L: G! n
对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。/ i! S. N+ O0 L. I+ c# y' K6 Z8 h
3 v2 P) i! c$ r! k3 U+ D# @ 2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。, o* d" ~: R% [, B, w
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7 I/ s. G3 `. F. C# u% b
% t' D+ i- C! V9 p5 } 由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。4 }/ W4 r& V7 L0 |/ f
/ A& v& V" L/ h: P7 r" N$ ?5 u 英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。, i5 `; D2 u) E
3 ^$ x: m% t1 I+ E0 z% f( F “自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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: V. {) k$ q6 \) _! H, N NPI依据的18本期刊如下：* Z S4 b$ { i* @4 L% I( k
* E+ d% q4 x6 f, g/ C" p+ c% u
Nature
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Nature Biotechnology, q% d/ M9 h L- A' M. ?
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Nature Cell Biology7 F) |; W/ T) P" W0 a) V
* M* u/ |& W, R1 d5 |* O+ x# d
Nature Chemistry
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( C; c8 M+ f" d; \3 _ b; k: Y Nature Chemical Biology
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Nature Climate Change
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4 Z. O$ @! C' d9 ^ Nature Communications0 r8 ^2 D: `! w- n& p ~
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Nature Genetics1 ^2 ~5 A3 s/ H9 d( I
& T& `; {9 R8 H: x' ? Nature Geoscience
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Nature Immunology
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Nature Medicine/ y. d( c+ u% d" ?& ~
0 F, ~& ]) N1 Q& O8 R Nature Materials) F6 C$ G l# x! _4 p/ H
r- f2 Y0 y. |" c3 b Nature Methods! Q2 V! J, m$ W! ^9 H7 k9 u
, T. w8 s+ z, N+ Y$ h6 o: }; w
Nature Neuroscience
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Nature Nanotechnology
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& k4 N! A1 o3 T1 d9 c Nature Photonics7 K A# ^- b5 h
* g8 V) o7 |1 W ]! l8 s
Nature Physics8 R; {" ~1 p( Z6 u0 J6 ?0 S9 l& T
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Nature Structural & Molecular Biology% v4 n n% h5 |4 r! K# i! y9 N- s `
3 K1 _. `( D( ^- A
而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。/ p7 g; f& j0 A) ^* A
2 e- `. ~& o, t3 J& s
NI依据的68本期刊如下：
. T* h3 h, W2 ]7 o! D- f# C* M6 F0 |9 I7 }1 p- D# X6 I
Advanced Materials& L0 |) N9 f/ x3 `' \
8 U+ `$ d& L% o& p. R7 L American Journal of Human Genetics
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. p/ |% t( n+ j7 N; ~# e Analytical Chemistry
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Angewandte Chemie International Edition( |7 r% F3 n& y t6 T1 M
0 l1 d/ Z9 L1 N5 i Applied Physics Letters
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( D+ {9 f! V3 I2 g! P1 V8 c Astronomy & Astrophysics. Z& X3 E; X9 x3 |7 ]" ^) ?
* D- c- H5 M5 p. c2 B( ^: [ `: c
Cancer Cell
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: g; t3 W: v* k2 e5 }& V" X# B Cell（《细胞》）0 I# r# a/ B0 k K H6 A! J
% i6 _2 e. O& W( {% E
Cell Host & Microbe. L& ~# u+ A- i8 Z. a8 l( J
H+ A$ U/ t u$ ?8 p) l4 B
Cell Metabolism
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- s: h' T' i5 V( }/ z Cell Stem Cell9 ^* p8 n ? k6 h4 R& }7 s
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Chemical Communications8 k3 N L' K$ w8 _& u9 P- ~
0 P. C2 l% [ c0 p; v
Chemical Science
8 o) _3 B+ q' l4 G: w% d
8 B H6 b# Y" @. d) L Current Biology2 a) q( f& w+ k( F4 l6 ^2 Y0 K
* n l n* g- _0 X" Z: ~7 }( a4 _
Developmental Cell$ N$ ]$ N- n* C1 f- N
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Earth and Planetary Science Letters* q, E. X" e+ i: ^
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Ecology5 n/ h8 A2 d9 Q1 b! D8 v. l
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Ecology Letters8 P/ N7 t& c! e9 |: @2 d2 Q
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Genome Research7 f5 l7 j3 {7 M5 H+ ~; P' [
+ M6 t) m8 x, N7 K9 } Geology9 H7 C) t$ {& Y# L5 G" B
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Immunity/ @: y- l9 V9 I% e H
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, ] @% O- l$ r0 ?. V5 i& N }$ R4 E
Journal of Geophysical Research: Atmospheres" w! q n: O0 b; G& u
; \: d' T) O+ H4 T- u8 X6 n5 N Journal of Geophysical Research: Oceans
; Z; W4 y$ M# q+ X2 m0 |8 j7 @, ]; D r! ~
Journal of Geophysical Research: Solid Earth" S: W/ C1 D: R0 q: K& b( d: q2 w
2 F" Z% B" q( }/ p. q" \$ L
Journal of High Energy Physics
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Journal of Neuroscience
' {" T5 ]; W" l. `$ s* f( k9 L% P
Journal of the American Chemical Society8 I4 x# n! w* D1 d3 ^
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Molecular Cell
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Nature Communications
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1 N% g5 y8 t* i- n E# p, R& i# D7 r Nature Genetics
% o7 e) I( X8 h# s7 Z6 n, W3 |. A
$ m; V" q) ?" C) {0 ? Nature Geoscience
4 v5 m; ]3 A8 Z' G2 q$ C# X+ l7 x5 m
2 Q" c6 {, s3 `4 b Nature Immunology7 _7 ^, \" ?" ~! z+ `9 w
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) r, j) H4 L c4 t7 U; r( c# X6 e# K5 m) P- q' f0 E3 f
Nature Medicine3 n9 @; } `: p
) f M) O$ z/ I Nature Methods
' |: K5 G- Z( f- P! t
% S9 ~4 y& R- U; d7 U1 G Nature Nanotechnology; d, m8 |0 \! y6 ?7 w; k& l: X) a% F# e
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Nature Physics
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