2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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! c3 M) `$ ]: C6 e& A c; D; u 消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。0 l9 z, h- b& o3 W& l1 R
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对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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; `- A# G# f" v- B$ m3 d 2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。' ]; Q+ b, ^/ Q3 W
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。/ A; p6 E7 v/ e9 c
: ]8 o$ T2 g7 Y f- G w9 D 根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。, A, S* q$ O) M7 s
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根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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" J2 d# {5 w1 S# X. _4 J2 v3 {( y$ c “自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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NPI依据的18本期刊如下：
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Nature! d2 N* G, ^1 U/ L8 {3 c: v
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Nature Cell Biology Y4 \9 B8 n0 `# p& b
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7 \) G% c: I/ ?" R Nature Chemical Biology
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4 E' r. x5 }5 q* Z4 {8 {' Y5 h Nature Communications
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Nature Genetics
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Nature Immunology
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Nature Medicine( X! ]9 W! c3 [/ z
& E1 _+ H3 Z* c) |! F
Nature Materials' k6 k. W# ~ l' m" V
. Z! F: i0 |& F/ W Nature Methods" n; f+ z- F4 D1 F: y
5 N8 a! H7 c) s( T4 P% O% M Nature Neuroscience9 U V# [5 ?6 J1 V, J
0 ^# D% T! Q% @7 O* ~) y Nature Nanotechnology( m. q9 j& v5 z D1 x5 K( Z; z$ R
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Nature Photonics' W; E/ s' g& q7 N; M
% z, B. |9 z; _9 y1 U8 C Nature Physics
4 q0 y, Z; j1 _4 E. W6 Z# @
$ {- i& Z8 R, r* a8 }( ^& W2 j8 P Nature Structural & Molecular Biology
# K' C& u! e( X3 E/ s# q( }4 o- Y
: k. G5 d7 @: q# _4 O 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。1 E2 B8 f3 `( H- k$ L$ c
# g) b) [5 A/ F- L NI依据的68本期刊如下：
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3 w: [6 P7 ?6 Y+ U Advanced Materials- l! Y) z% k. H2 e
7 Y' p7 {$ X2 H, \, {3 i% X
American Journal of Human Genetics
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Analytical Chemistry/ y4 \6 O/ j0 \8 u2 |
1 c+ N$ i9 R; f- ~ Angewandte Chemie International Edition
9 g& L0 O' R- j: n9 N. o; V d+ U. A9 W- p" o
Applied Physics Letters' i4 V- O/ E7 I& g" |. @. a
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Astronomy & Astrophysics
7 N, b! [% M7 H9 M& m8 H
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4 c# M0 q2 J9 i" E: [: I& I5 u
( M6 _6 H+ o1 P; ]0 V Cell（《细胞》）
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Cell Host & Microbe3 e/ O) N( H- A( b& [2 `
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Cell Metabolism5 v4 m' `8 t+ @( a- K6 P% A
" X4 P: o7 D; |( B Cell Stem Cell' v0 |: w" T" v8 T$ S+ J: d
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Chemical Communications+ ~9 q: {$ v' _% ]" X, Z
) m( C8 A/ O- q6 ~
Chemical Science
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Current Biology
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Developmental Cell7 }7 G& }( b5 j7 v: S
: P k( H' v Y" Y
Earth and Planetary Science Letters2 |' c6 v6 E1 O a9 c
3 g1 l9 f) Z* ~7 r9 X. ?8 u Ecology
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3 T( ?4 {$ O: ~& f* c: w Ecology Letters
9 R1 \8 h& Y3 W2 @: j! x0 ~& K5 p! ^) h' Q9 Z# D: u$ a
European Physical Journal C
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* v$ i$ Y- M* S0 C. M/ j {/ t
' G: k/ o; p: W9 x$ }' K/ N Inorganic Chemistry
- I- I( t) d# j7 Y' E0 c* M7 `& h7 V O8 h% Z$ d% S
Journal of Biological Chemistry
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Journal of Clinical Investigation
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Journal of Geophysical Research: Solid Earth
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Journal of High Energy Physics
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4 v1 e6 L3 P! O6 g Nano Letters$ P/ ]( E8 d0 Y( Z) ]' C
2 N; ?; x, a+ a7 E9 e1 K# j2 O
Nature （《自然》）4 O9 \/ j( H4 ~% N% A0 r
4 h$ H4 P& f, H3 S
Nature Biotechnology4 o7 D. E9 ~2 U# P4 r# v0 g0 t
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Nature Cell Biology
S7 ~" t1 j; h8 w {( O# ~7 m" d1 \; a; b2 I0 O
Nature Chemical Biology
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Nature Communications
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Nature Genetics. M. F$ W; s% A. T2 j& |3 B: A
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" N% [) G! H; }+ Z9 G
Nature Immunology7 x6 R0 a5 B# b! l( J2 d2 R
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Nature Materials
) D# t; b# \/ R# ~3 K% b' |1 h$ Z8 k# L* t; L
Nature Medicine
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# Q3 u. u0 W8 X1 p4 i$ [$ n- z Nature Methods/ m# M9 k- g1 y* d8 J) H, U. P1 H0 S
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Nature Neuroscience
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PLOS Biology
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Physical Review A
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Physical Review Letters
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The Astrophysical Journal Letters4 l! Y% G( @% N- O C4 {3 g! w2 i
7 L& G- [- X6 N/ p# Z
The Astrophysical Journal Supplement
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The EMBO Journal
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The Journal of Physical Chemistry Letters
. j7 f: A0 ]+ \# ]+ ]
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