2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。9 ~6 n2 v0 v: X4 L
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消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。, N3 O! N2 f3 y7 r+ \ V. P' R
( S0 s; O( \ d$ g0 P; k5 C- L7 F# N8 p8 T
对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。1 {0 M- ]* S( d2 [
' X$ d( f7 [3 e T' A" ?) D/ ^3 U 2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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4 h7 O& q# a6 q) Q, F 根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。
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' {/ \" _1 _' L% V& @+ D, C 英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。# I Q! b& A" I2 F% W+ Q
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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NPI依据的18本期刊如下：) p4 `# l" K- i
1 n5 |" n8 x9 j& N Nature9 Q1 `2 f) O% F! c$ \# u- `5 j* S- R
+ `7 |4 V+ v: @* V6 A4 x+ c' a Nature Biotechnology& t, ~( j6 {% o$ b7 R& L
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Nature Cell Biology
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Nature Chemistry2 ~& ]2 i- V1 }6 K- I
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Nature Chemical Biology
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Nature Climate Change
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Nature Communications3 b( h2 F% ^* U1 h _- d, h1 A
" Z+ I6 z( K! s3 x- W Nature Genetics
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7 N2 x5 P/ k( i J1 H B u) l: M Nature Geoscience+ n& ]# A* K) }8 v7 L
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Nature Immunology7 b- k" S o6 n1 i, _
6 r. @/ u9 H) r7 U4 Q- g" ]$ [9 L Nature Medicine
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Nature Materials5 P( W- J; W3 p5 [" S L
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Nature Methods
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Nature Neuroscience; u$ g' o( w5 S+ l6 s( Y
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Nature Nanotechnology4 E' ?, M- B" b# b
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Nature Photonics( q+ J) ]/ C1 w8 a
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Nature Structural & Molecular Biology0 d& U Y+ @" }# R# u5 I1 ?; R% n/ F
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而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。5 r; _+ g' K) [& Q! ?: l" X2 Q- K
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NI依据的68本期刊如下：% J# |6 w$ V0 h1 a% Y+ q) Q& p0 ]
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American Journal of Human Genetics& f7 _2 j M, |: f2 x9 k" {
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Angewandte Chemie International Edition
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Cancer Cell
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Cell Stem Cell2 }2 i* T, U! x' _0 b) J
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Chemical Communications. z# n# W/ s9 d" |* S, i
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Chemical Science
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: L) E+ A! @! N% y2 p1 H Developmental Cell
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Ecology6 G/ s; Z$ c0 n+ U
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Journal of Clinical Investigation
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' g0 N3 y. E" i' c Journal of Geophysical Research: Oceans
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Journal of Geophysical Research: Solid Earth! X9 G7 L0 L# L, K! U3 m
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Journal of High Energy Physics
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Nature Chemical Biology
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Nature Chemistry8 h9 T" t5 ~& t5 g$ u1 r
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Nature Communications( Z) c7 v! n2 y
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Nature Genetics4 k/ p: J7 @2 i$ U" Q. t
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- t1 _4 G1 z% x5 W3 i) t9 r1 @ G: J Nature Materials
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5 }, U+ x+ a* _7 K" } Nature Medicine
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Nature Photonics
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