2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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8 I5 C9 o+ _* k/ ?' k3 P C2 M) D) ^ 消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。
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对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。& O& @8 o1 }3 g# [
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由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。5 H# `/ \7 a2 u, X$ g' N
6 j! E9 z: S0 z! L, z! m1 `! X' e 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。9 Z, B( u, C" ~
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。& v2 c* {0 }3 }- h8 ~ w F
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NPI依据的18本期刊如下：0 A9 Z8 l; w {& ~ Z! A+ z
' a1 ?" s- k, z" e% j( w8 N
Nature
* B7 }3 P& I3 L$ I' C" ^6 S
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Nature Chemical Biology
+ O$ F: [5 c5 [' x, W; i, r0 d! I* k# l6 o- `9 H8 o
Nature Climate Change3 \1 F" t: [/ @/ Y# q' o0 v
2 J: a& G! F7 @/ ~4 e7 A# }
Nature Communications: y# _6 x5 Z- [& N- y5 R& K3 _/ M
0 F0 D! C7 |7 R: Y3 L Nature Genetics& {+ \, Y! s% i& K" n! ?* Q
0 S) q6 {& G9 C4 q, p/ ~
Nature Geoscience
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Nature Immunology; ^) B3 P% \$ O9 B5 y0 L
3 y4 K: x+ @, A h8 U9 k Nature Medicine5 \9 @6 Q1 r- J
! ~0 E; u9 o X Nature Materials
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, w2 C* A/ J! Y W4 ~/ V: M! T Nature Methods! N# I2 v2 X3 H+ h& }
4 j* Q' B0 r3 n" r4 E/ [/ X5 N W' W5 A Nature Neuroscience' V5 Z0 i4 G/ Z [/ A/ W
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Nature Physics% G! m2 Y4 J$ E' ~9 s# O- p
8 Y& e* h/ K; J2 b+ T# R Nature Structural & Molecular Biology3 t" g$ H7 [/ t2 q6 ~ W
+ ]1 l/ [7 d3 u% C% Z
而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
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4 N, m$ l9 R( [: W" [" t9 w/ w NI依据的68本期刊如下：
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, j2 z- Y5 S4 Z6 D' \, p4 N7 _" s' n; r/ _3 F6 P
Angewandte Chemie International Edition
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Applied Physics Letters
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) i% Y6 Y0 s2 |5 K1 M
Cancer Cell
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Cell（《细胞》）- Z4 r" C# M m% f
1 t: L$ r/ v" {- M
Cell Host & Microbe
8 s u7 ]+ J! U) g
6 Y" K2 Q) i+ i2 M. v# a4 ^% b Cell Metabolism
0 `. F) L6 j# A( Z- P2 ~- d& u' Z9 B9 K+ H" e. C
Cell Stem Cell. u9 e5 h( J7 M: I& b+ R% ~9 x
0 L: V& v. Z8 U4 ^+ k# k; f
Chemical Communications4 \3 X. k2 D8 ^. E. O$ M9 D+ n
4 {2 W8 Q, l; u" b7 l Chemical Science
+ T1 T8 ]' }: V) G
+ y3 l" q! l. o( ` v$ E! ? Current Biology
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Developmental Cell7 N5 M* @, Q+ q1 H
3 p$ |9 w+ W6 M$ |2 F7 p
Earth and Planetary Science Letters
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Ecology
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+ m/ A m; t/ U+ Q7 i Ecology Letters
; v) d6 D( k9 Z: \4 Z! c. D) y, ]4 g3 b/ I) l; n4 O
European Physical Journal C
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Genes & Development
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Genome Research9 }: m( B0 @! T: R" O, a
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Journal of Clinical Investigation2 G4 i5 k6 L" j, r, F) V
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3 j' e8 p: v0 ^" W9 `( K! O7 J& e" `
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Nano Letters
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Nature Chemistry
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* n5 Y& a9 X- s0 F/ E Nature Communications
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A$ Z" H7 f1 s2 u* |! Q Nature Genetics
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Nature Materials
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! B7 y: S" Z d Nature Structural & Molecular Biology$ ~! Q0 I0 F' n3 F, Y( g; w. ?
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Organic Letters4 Q- a1 N/ I8 l" Y; a% J3 ]
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PLOS Biology
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