2015年6月18日，《自然》杂志发布2015年全球自然指数（2015 Nature Index）。此次发布的2015全球自然指数涵盖了2014年1月1日至12月31日发表在68种世界一流科研期刊上的57501篇论文。其中，中国科学院仍然是自然指数中位列全球第一的科研机构。
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3 _( h/ A- ^( h& @; t 消息一出，不少人对此产生质疑。因为根据“自然”网站公布的2013年的自然出版指数（NPI）显示，中国科学院位列全球第六，相关计数值（CC，corrected count）不到哈佛大学的一半。仅仅一年，中科院就远远超越了哈佛大学，稳居世界第一，这的确让人有点匪夷所思。
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对此，观察者网进行了查询，原来在2014年，《自然》杂志对这一指数进行了修正。《自然》杂志将统计指数名称从NPI（nature publishing index，自然出版指数）改成了NI（nature index，自然指数）。统计的收录论文的期刊也从18本扩展到了68本。
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2014年12月，《自然》杂志首次以全新的“加权分值计数法”（WFC，weighted fractional count）指数方式发布2014全球自然指数（Nature Index），对2013年的相关数据重新进行统计。结果，在全球前200名科研机构中，中国科学院自然指数排名第一。
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1 ]% L+ T1 C# N1 q; k
* u" q) x* B# k+ H1 ` 由于，中科院在《自然》杂志上发表的文章较少，但在其他杂志上发表了不少论文。因此在NPI排名中的位次较低。在对指数进行修正以后，中科院的排名大大提升。
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6 E; n( U9 I' x4 ? 根据“加权分值计数法”，若每篇科学论文的作者数为N，则将每一位作者对该篇论文的贡献记作“1/N”分，而不是都记为“1”分，同时考虑了不同学科之间的权衡问题，将学科优势和研究成果纳入分析中，因此更能反映一个作者、机构和国家对世界科学的贡献率。
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$ D- ~, E( e4 t 根据加权分数式计量，中国位列第二，仅次于美国。中国的 WFT 从 2013 年到 2014 年增长了 16%。自然指数显示，中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国。本地区位居前五的机构中，中科院的论文合作比例最低，北京大学最高。4 c( [1 X) v' I0 V' ?3 g, |
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英国著名杂志《自然》是世界上最早的国际性科技期刊，也是国际最权威的科学杂志之一，自1869年创刊以来，《自然》杂志每年都会以前一年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对往年的数据进行比较。
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“自然出版指数”（NPI）是根据各科研机构与高校在《自然》和其他17本自然系列研究期刊上出版的文章数计算，常被作为衡量高质量的基础性研究的标志性指标。该指数每月更新一次，记录过去12个月内发表的文章数据。
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' f" k' u6 h% h" `6 c NPI依据的18本期刊如下：- ?. A) f; P4 `$ b
! O$ @4 G4 V& c E Nature# K% ]8 a% m8 v* M x
- `3 J l2 f; l$ E" F4 w
Nature Biotechnology
6 J( p; v+ s; c& T; L9 C, @7 J( i$ N, U0 M" `! O# Q1 `, E
Nature Cell Biology
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Nature Chemistry
t& D# P& `/ B* K8 G; C2 j6 Y; y9 m, z+ k
Nature Chemical Biology) y( ^) N2 i, ~
# J: W8 g9 C; m6 E- J Nature Climate Change
* q6 h+ H6 X% e6 B2 |4 z! h1 U* \* L6 ] {- |
Nature Communications# x* o1 b/ p1 [& S; F5 Q) l
. p3 M0 K( h! ], G/ A% K Nature Genetics
4 U" \0 _- E2 [( W) ?5 ^' i+ x6 h
+ [8 B- T" V- B, O- e/ h7 R Nature Geoscience
1 {/ X) e5 M2 ?4 e7 |3 F: w2 { ], H* k
Nature Immunology# X' B( E) M1 V+ w& B2 f
! C2 O" t: }$ k Nature Medicine) _. {0 X) i) V K, u4 t) `9 |
" H* R% N0 b& k8 y; }3 F
Nature Materials! p. {9 v* k3 A5 M# B: E
4 c5 H! P/ D. p Nature Methods
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Nature Neuroscience
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Nature Nanotechnology& M, C5 L. d; o$ e" c7 T8 Q. \+ c
I. r. o" a, r% O1 N- ~* G. m
Nature Photonics
9 g2 z% k3 [0 l. K/ G
! C% i7 G5 c% q( G& T0 l Nature Physics
( ?+ f# N9 Z: }+ H! d( q& P2 o+ c5 a+ R6 W
Nature Structural & Molecular Biology" n& u4 I1 ] D* ~
Y; ?' N- ~/ n: }) A( h- F 而“自然指数”（NI）是衡量国家与科研单位（大学）科研水平的新的指标，“自然指数”的依据是包括《自然》、《细胞》、《科学》在内的68家期刊。 68家期刊，是因为Nature集团基于学界的评价，把它们看成是科学界各学科最好的学术期刊，有人甚至认为，没有在这些期刊经常发表文章，就等于远离前沿，而且对你单位的学术影响力（“自然指数”）亦就没有贡献。
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NI依据的68本期刊如下：
5 j" A0 ^6 A3 |( l; T6 ]* ^' V4 `( |; c, _! Q6 y" |' W
Advanced Materials
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American Journal of Human Genetics
- H& p/ S1 z5 |: C* w* {6 w' a# }4 [
Analytical Chemistry
. L$ h5 n( ^9 N$ E
6 l9 p" c" u B {( ?0 H Angewandte Chemie International Edition
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7 i5 ~2 P1 n' N Applied Physics Letters( m( P. H) L* O, P
( ^1 ]5 ?; V, [
Astronomy & Astrophysics# W1 f( U7 p* m" W4 l
5 s' x! R1 L$ J0 G' ^" G3 h
Cancer Cell+ F) e6 z/ t8 W9 ~, B, {- L
" |' g6 [ n+ }. ^0 o Cell（《细胞》）
6 ^ h; w% L! u8 X8 t- m+ V9 M% ^; x
Cell Host & Microbe# H& Q! v8 Z0 c, o2 R. O1 z
! Y2 e, J# k8 I2 [% M2 o, w7 @6 O+ c Cell Metabolism
4 R1 r3 ^1 L5 \* [: s9 d% z: Y! k0 X# B
Cell Stem Cell
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Chemical Communications2 e. q; l1 V* D: j' u+ |, x4 m
* L* @8 c) b& Q @$ v- g Chemical Science
8 [& ]1 ^1 f' U! R2 B0 ^* A! ` N, |) J4 p C7 e1 x6 \6 B2 X8 c
Current Biology
4 }/ K. g6 x& @, i0 G, L# H0 Y2 M3 }& Q5 L0 o# }( t6 j
Developmental Cell
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Earth and Planetary Science Letters6 C( h# N3 F2 o
, \" f" l+ d1 p2 K$ P% [- [8 \ Ecology
" {$ M u9 y1 |2 A* }. c; w3 L6 H u/ u6 |, _, \
Ecology Letters. W0 G8 D% ~: D9 S% c4 t/ \9 y
' B& _ i# A7 @8 R
European Physical Journal C
% W! A; S2 N9 k" v
0 `( W6 D7 h+ f# r, _5 U6 \/ O2 } Genes & Development
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Genome Research
& o- F8 X* D' s2 y. }
& }* E' r6 p' ]: `/ _ Geology
, ~* j! h$ k5 v/ g! o8 _; Y) J8 V( S
Immunity
- |$ c" g5 J- r2 F/ @$ a6 D; ?7 g% G' o! |: U1 i5 X# O( }" f4 r/ X8 [
Inorganic Chemistry- w: w) h* G" S
3 Q/ [% b( G. o% G% [ Journal of Biological Chemistry
2 ~$ w. a9 |3 m, r! |7 q, @) s5 j( F( O+ j" a
Journal of Cell Biology: G8 v. K1 z3 @% Z0 |
& Y2 o4 i# f3 Z' W$ _! I& U/ _
Journal of Clinical Investigation, h0 C3 \/ N0 U" P# U5 G d
3 e; W# G+ N1 E* ^
Journal of Geophysical Research: Atmospheres% J' k, T' D9 P. j( o
! S t- l8 T( ?7 a Journal of Geophysical Research: Oceans4 F v- b1 _1 ?; Y0 A
& R3 a& H' G; A& d) K7 j+ T
Journal of Geophysical Research: Solid Earth) Z) S' a. K# R% H
3 m, n$ q, U# Y, B0 C: W( j, H+ {
Journal of High Energy Physics9 R u, T/ f! O5 u; h, w) ^3 e. Y8 m
/ |& e0 B/ N( Q$ J/ h' P0 j B
Journal of Neuroscience/ b0 w5 |* I: G; O
# s. _$ M; y) k9 J# K7 {# n
Journal of the American Chemical Society
& @6 p2 K0 I/ f/ s5 N! H8 C2 _) h8 f1 V, A9 x
Molecular Cell5 c( F1 G3 P3 p* U
/ o- Q3 n# }: ~8 ]
Monthly Notices of the Royal Astronomical Society
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& Y; }5 g* z: w" M* G Nano Letters
8 Q- W& e' g3 m1 r I" B; i1 T" u& P: N! }6 K o( j
Nature （《自然》）
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: D9 d- Q9 G. D8 T _ Nature Biotechnology4 I. C% I u+ n' Q; x; S
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Nature Cell Biology8 C& Z, C- u: W0 C8 n" \: f+ @0 Y/ q$ `3 J
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Nature Chemistry! d! s& n% m. b- {1 n1 T
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Nature Communications
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# g0 m( Z$ D7 P+ L% u1 E Nature Genetics5 O# r& G+ @/ k
& x2 j- Q4 { Z1 g @* A- k; o Nature Geoscience4 }$ e" }( u0 j5 L9 ~
* n2 \, R- o6 `3 [5 d: j- k Nature Immunology
* Y& A2 G$ P" z1 e- _' F2 ]7 [% w$ s$ y% S' d7 f+ H9 B; z8 ~
Nature Materials1 U% o1 Y3 S7 h' R! t
) c7 M* h( v( D% Y. b F, y( T Nature Medicine2 H) m" m: s; \9 p) l+ y1 r# @
- U" S9 u; b# W$ E- O, n/ K Nature Methods
$ m5 K/ ~4 z9 ?5 b* J0 g% d2 z/ {5 C% T
$ W0 U6 X: d5 ]9 z" [ Nature Nanotechnology
/ L5 j x0 p- p5 ?$ _
& R3 ]5 u; I. }: I Nature Neuroscience( Z. O+ b7 J7 A( l" V- u
5 }( t. A" s9 d: E, F3 s, T Nature Photonics% A( n' f; P3 z$ n9 W
# A0 B5 A3 B: U6 p& h9 v: C0 u Nature Physics& B" G3 C6 }1 B% b6 n! C
# `. C& d. I+ [1 ~5 I O/ ~1 [5 [
Nature Structural & Molecular Biology# K$ C/ K% e# s8 ^: [* S! Y5 n
$ N, v- Y; h8 S* ^7 R! s3 t
Neuron& y! q' ?* ?3 E
8 E H3 n0 h3 z& B/ Y. D+ ] Organic Letters/ }1 _, Q& H0 y
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PLOS Biology
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Physical Review A! P' M" o3 s" L2 T
8 i7 l. g, z: |, ^- e/ z3 M" A Physical Review B" G* b) G. i1 q! i/ l" t6 I
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Physical Review D0 p4 `% H% W; S; V
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) }! y. j; C' N. w
* ^; U, Q$ }) O Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America: P9 ^6 s6 y: G& l: c; m2 E; n i
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I, B) f1 Y7 _! M
The Astrophysical Journal
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The Astrophysical Journal Letters' u7 [* |* V* x$ L
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The Astrophysical Journal Supplement
7 @+ ^. }9 z& Q, V/ e( l9 t" b
4 |3 s, F i8 z0 \2 p The EMBO Journal, j( t, B- H2 m" }- U& O3 V& L
4 ^. @' j& \' q& g) c2 b+ r% H3 ]
The Journal of Physical Chemistry Letters
* v8 \* A. b$ ~+ Z' w
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